87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1225 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  91.5 
 
 
357 aa  654  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  91.22 
 
 
355 aa  654  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.31014e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
355 aa  732  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.75809e-07  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  91.22 
 
 
355 aa  654  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  5.6797e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  90.08 
 
 
355 aa  651  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  3.08183e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  92.35 
 
 
357 aa  659  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.48184e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  91.22 
 
 
355 aa  654  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.68805e-07  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  91.22 
 
 
355 aa  654  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  9.6707e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  91.5 
 
 
358 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  4.65021e-08  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  91.89 
 
 
335 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  3.24695e-06  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  91.89 
 
 
335 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.24231e-08  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  91.89 
 
 
335 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  4.60708e-08  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  91.29 
 
 
335 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  90.69 
 
 
339 aa  613  1e-174  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.50987e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  82.58 
 
 
340 aa  549  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  70.87 
 
 
342 aa  481  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.00279e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.68 
 
 
375 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 
366 aa  159  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  34.22 
 
 
357 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  34.25 
 
 
355 aa  152  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  34.25 
 
 
355 aa  152  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.25 
 
 
355 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  35.48 
 
 
339 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  33.91 
 
 
348 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  32.03 
 
 
384 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 
381 aa  147  2e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
353 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
354 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
366 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 
353 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
353 aa  141  1e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  27.62 
 
 
360 aa  141  2e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 
365 aa  141  2e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  30.57 
 
 
361 aa  141  2e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
363 aa  132  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  28.07 
 
 
340 aa  119  8e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.77 
 
 
618 aa  62.4  1e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.77 
 
 
618 aa  62  2e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  21.61 
 
 
513 aa  54.7  2e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  22.22 
 
 
348 aa  54.3  4e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  27 
 
 
1156 aa  52.8  9e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  20 
 
 
459 aa  51.2  3e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  21.86 
 
 
645 aa  51.2  3e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  24.04 
 
 
701 aa  50.8  3e-05  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  22.95 
 
 
725 aa  50.8  4e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  23.81 
 
 
1037 aa  50.4  5e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  25.14 
 
 
367 aa  50.1  6e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  23.89 
 
 
681 aa  50.1  6e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  23.08 
 
 
1119 aa  50.1  6e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3830  adenylate/guanylate cyclase  25.74 
 
 
486 aa  49.7  7e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3904  putative adenylate/guanylate cyclase  25.74 
 
 
486 aa  49.7  7e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0256204  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3816  putative adenylate/guanylate cyclase  25.74 
 
 
486 aa  49.7  7e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  26.25 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25 
 
 
656 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  22.95 
 
 
488 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  24.04 
 
 
701 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  23.5 
 
 
699 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  23.08 
 
 
607 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.33 
 
 
753 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  24.02 
 
 
729 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.47 
 
 
643 aa  46.6  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  21.51 
 
 
400 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  21.05 
 
 
651 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  20.32 
 
 
752 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  25.37 
 
 
422 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  21.96 
 
 
694 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.06 
 
 
657 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.05 
 
 
764 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.34 
 
 
754 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  22.28 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  20.09 
 
 
665 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  22.64 
 
 
675 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  20.88 
 
 
723 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  20.54 
 
 
703 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  19.1 
 
 
741 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  22.22 
 
 
469 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  20.33 
 
 
723 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  21.93 
 
 
592 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  21.81 
 
 
759 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  25.5 
 
 
370 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  21.86 
 
 
643 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  20.29 
 
 
637 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  22.1 
 
 
421 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  24.07 
 
 
1046 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  23.24 
 
 
1020 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  19.23 
 
 
746 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  22.71 
 
 
401 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.805634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>