252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1184 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1184  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
154 aa  325  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  35.65 
 
 
167 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3440  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.28 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  32.82 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  30 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.62 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.32 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  31.78 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.33 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  31.01 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2551  alkylhydroperoxidase  33.65 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2501  alkylhydroperoxidase  33.65 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  33.59 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  30.56 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  29.92 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.76 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.93 
 
 
159 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  29.46 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  33.85 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  34.19 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  30.17 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.17 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.46 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  29.46 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.06 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  29.46 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.33 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  33.58 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.94 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  27.74 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  35.65 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  35.65 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  35.65 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  35.65 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  35.65 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.91 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  34.68 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  30.08 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  29.58 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  30.08 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.45 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.83 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  30.91 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.09 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.11 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3956  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.07 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405644  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  29.06 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4069  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.07 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0737  alkylhydroperoxidase  32.73 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213985  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.58 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.09 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  30.58 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.34 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.09 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.63 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  28.89 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  26.62 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.45 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.77 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.83 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  29.57 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1903  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.57 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.52 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.09 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  26.72 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  34.81 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  34.81 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3196  alkylhydroperoxidase  32.17 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  29.55 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.25 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.55 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  27.97 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.71 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.31 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.25 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2623  alkylhydroperoxidase  36.11 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  30.99 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.2 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  33.61 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  33.64 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2935  hypothetical protein  34.26 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  26.76 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  30.47 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  33.06 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  36.04 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  33.61 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  35.14 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.64 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.8 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.82 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.14 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.61 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.58 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  35.14 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4101  alkylhydroperoxidase  32.41 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.94 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  29.23 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>