More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1179 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1179  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
233 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3035  SNARE associated Golgi protein  79.45 
 
 
243 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0684  inner membrane protein  69.91 
 
 
222 aa  316  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000347  DedA protein  52.4 
 
 
226 aa  249  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06156  hypothetical protein  57.71 
 
 
225 aa  247  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0467  DedA family protein  43.64 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020766  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3763  SNARE associated Golgi protein  37.21 
 
 
219 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4213  SNARE associated Golgi protein  40.22 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209059  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3600  SNARE associated Golgi protein  36.45 
 
 
220 aa  145  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3436  hypothetical protein  36.19 
 
 
219 aa  144  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  36.82 
 
 
220 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  36.82 
 
 
220 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3417  inner membrane protein YqjA  36.82 
 
 
220 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3414  inner membrane protein YqjA  36.82 
 
 
220 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3521  hypothetical protein  36.82 
 
 
220 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.946081  normal  0.0157563 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02882  conserved inner membrane protein  37.5 
 
 
219 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0690  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.5 
 
 
219 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4319  hypothetical protein  37.5 
 
 
219 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3293  hypothetical protein  37.5 
 
 
219 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.787334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3477  hypothetical protein  37.5 
 
 
219 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02832  hypothetical protein  37.5 
 
 
219 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3187  hypothetical protein  37.5 
 
 
219 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3549  hypothetical protein  39.66 
 
 
220 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.743945  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0687  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 
219 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3567  putative inner membrane protein  39.66 
 
 
220 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02964  conserved inner membrane protein  39.66 
 
 
220 aa  141  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0606  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.66 
 
 
220 aa  141  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3282  putative inner membrane protein  39.66 
 
 
220 aa  141  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468138  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3266  putative inner membrane protein  39.66 
 
 
220 aa  141  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02915  hypothetical protein  39.66 
 
 
220 aa  141  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3393  putative inner membrane protein  39.66 
 
 
220 aa  141  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4410  putative inner membrane protein  39.66 
 
 
220 aa  141  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0601  SNARE associated Golgi protein  39.66 
 
 
220 aa  141  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  40.22 
 
 
223 aa  141  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329585 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0383  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.74 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0743  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.15 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0340  SNARE associated Golgi protein  37.93 
 
 
219 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0526  SNARE associated Golgi protein  39.77 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  39.11 
 
 
232 aa  138  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  39.11 
 
 
232 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  39.11 
 
 
232 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3388  SNARE associated Golgi protein  37.43 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0670  SNARE associated Golgi protein  35 
 
 
220 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0589  hypothetical protein  35 
 
 
220 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0270  hypothetical protein  35 
 
 
220 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3336  hypothetical protein  35.71 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3514  SNARE associated Golgi protein  39.11 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.443365  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3511  hypothetical protein  35.71 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3416  hypothetical protein  35.71 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3410  hypothetical protein  35.71 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.998895  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3345  hypothetical protein  35.71 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.666146 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3419  hypothetical protein  34.29 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0026  DedA family protein  38.32 
 
 
216 aa  123  2e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1720  DedA family protein  25.57 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  31.68 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  31.12 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  26.61 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  28.16 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  28.37 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  28.02 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  26.52 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  31.21 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  29.67 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  30.43 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  28.29 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  25 
 
 
215 aa  72  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  26.99 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  26.2 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  24.03 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  25.53 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  25.99 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  25.14 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  30 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  27.39 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  27.32 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  25.66 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  31.85 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3854  DedA family transmembrane protein  29.12 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  23.38 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  28 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  31.06 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  25.86 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  24.38 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  31.06 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  31.06 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  24.11 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0282  DedA family transmembrane protein  29.67 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 
206 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0766  DedA family transmembrane protein  29.67 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  29.25 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  31.06 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  31.06 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  31.06 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  31.06 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  25.7 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  30.87 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  29.33 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  25.61 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  27.27 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>