More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1176 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1176  cytochrome c class I  100 
 
 		 110 aa  224  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000869093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  56.19 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0006  monoheme cytochrome c  50.55 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0714  monoheme cytochrome c  46.46 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0006  monoheme cytochrome c  50.55 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0006  monoheme cytochrome c  49.45 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  36.36 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  41.67 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  35 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  48.44 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  45.31 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  43.75 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  38.46 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  34.69 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  45.31 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 200 aa  63.9  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  40.62 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  39.06 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  39.06 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  40 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  40.62 
 
 		 105 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  36.17 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  40.62 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  41.27 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  38.75 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  41.54 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  39.13 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  39.73 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  33.01 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  41.27 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  44.78 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  38.96 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  35.11 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  36.46 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  40 
 
 		 292 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  33.85 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  34.38 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  36.46 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  36.46 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  34.17 
 
 		 265 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  33 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  33.33 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  33.85 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  33.85 
 
 		 198 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  35 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  43.28 
 
 		 200 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  38.67 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  41.27 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  29.9 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  38.24 
 
 		 238 aa  57  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  34.15 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  35.09 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  36.84 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  38.95 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  39.68 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  40.62 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  34.69 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  35.38 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  37 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  36.51 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  38.71 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  39.47 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  38.57 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  40 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  32.14 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  37.5 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  29.9 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  39.06 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  41.25 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  30.11 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  31.96 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  34.92 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  37.5 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  38.81 
 
 		 271 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  37.5 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  36.51 
 
 		 206 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  38.03 
 
 		 215 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  36.14 
 
 		 270 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  38.03 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 218 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  38.03 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  38.03 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  29.09 
 
 		 212 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0979  cytochrome c class I  39.06 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0035019  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  32.26 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>