More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1173 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  100 
 
 		 136 aa  274  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0979  cytochrome c class I  66.06 
 
 		 136 aa  156  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0035019  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  43 
 
 		 221 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0009  cytochrome c class I  50 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000357526 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 222 aa  90.1  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  41.18 
 
 		 222 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0009  monoheme cytochrome c  48.81 
 
 		 111 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0009  monoheme cytochrome c  48.81 
 
 		 111 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00972927 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0717  monoheme cytochrome c  48.75 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  55.38 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  50 
 
 		 318 aa  77  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  51.56 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  43.75 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  44.93 
 
 		 200 aa  72  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  43.37 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  40 
 
 		 211 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  44.19 
 
 		 225 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  39.6 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  44.12 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  41.11 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  40.51 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  41.03 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  39.74 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  42.65 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  40.7 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  40.85 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  42.53 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  42.53 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  34.59 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  40.51 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  35.92 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  39.53 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  42.65 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  36.71 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  33.98 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  43.94 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  43.84 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  33.66 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  39.77 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  43.48 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  43.48 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  39.33 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  35.11 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  41.79 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  39.77 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  44.59 
 
 		 206 aa  60.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  39.77 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  38.3 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  40.7 
 
 		 217 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  37.97 
 
 		 222 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  40.23 
 
 		 217 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  37.08 
 
 		 219 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  44.12 
 
 		 209 aa  60.5  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  39.74 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1072  cytochrome c553  40.91 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.538556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  41.46 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  39.53 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  38.81 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  42.31 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  37.08 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  40.51 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  39.53 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  39.53 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  34.52 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  40.28 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  37.62 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  39.53 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  43.33 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  40.85 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  43.06 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  38.03 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  39.33 
 
 		 265 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  35.23 
 
 		 246 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  39.71 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  40.85 
 
 		 271 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  41.89 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  40 
 
 		 206 aa  57  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  31.45 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0006  monoheme cytochrome c  41.27 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  38.36 
 
 		 218 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  37.33 
 
 		 229 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0006  monoheme cytochrome c  41.27 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  38.24 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  40.91 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  33.33 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>