59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1027 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1027  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  364  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.30627e-08  normal  0.110707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  64.25 
 
 
196 aa  226  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  58.62 
 
 
178 aa  213  1e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.10345e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  58.62 
 
 
178 aa  213  1e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.21835e-05  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  58.38 
 
 
178 aa  213  1e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  9.98217e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  58.38 
 
 
178 aa  212  2e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.51719e-09  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  63.31 
 
 
178 aa  190  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.17216e-05  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  62.13 
 
 
178 aa  189  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  56.5 
 
 
178 aa  187  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  63.31 
 
 
175 aa  185  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  61.88 
 
 
178 aa  182  2e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  6.13639e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  58.19 
 
 
179 aa  172  2e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.67629e-07  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2803  hypothetical protein  54.09 
 
 
175 aa  170  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.316903  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0875  hypothetical protein  60.8 
 
 
184 aa  165  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.48389e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  55.28 
 
 
192 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  36.16 
 
 
183 aa  94  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00940  hypothetical protein  30.41 
 
 
200 aa  81.3  7e-15  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  30.73 
 
 
188 aa  67.4  1e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0993  hypothetical protein  52.73 
 
 
55 aa  61.6  5e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3296  hypothetical protein  51.85 
 
 
55 aa  60.8  1e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.766582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  25.53 
 
 
186 aa  59.7  2e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  29.23 
 
 
189 aa  58.5  6e-08  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  29.14 
 
 
196 aa  57  1e-07  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  26.18 
 
 
189 aa  57.4  1e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  26.67 
 
 
185 aa  57.4  1e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  27.75 
 
 
185 aa  56.6  2e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  8.68105e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  28 
 
 
187 aa  56.6  2e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  26.37 
 
 
175 aa  53.5  1e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  28.27 
 
 
189 aa  52.8  2e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  27.69 
 
 
176 aa  52  5e-06  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  29.07 
 
 
188 aa  49.7  2e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  24.28 
 
 
174 aa  49.3  3e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  24.59 
 
 
185 aa  48.9  4e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  24.6 
 
 
186 aa  48.5  5e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  24.6 
 
 
186 aa  48.5  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  24.6 
 
 
186 aa  48.5  5e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  4.14512e-11 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  27.84 
 
 
189 aa  47.8  8e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  24.71 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  25.14 
 
 
186 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  24.6 
 
 
186 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.03923e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  25.99 
 
 
181 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  26.14 
 
 
186 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  28.81 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  23.94 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05585  hypothetical protein  25.71 
 
 
173 aa  44.7  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  28.41 
 
 
187 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  24.26 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  26.01 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  25.57 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  25.57 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  6.75373e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  26.44 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  26.86 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  25.57 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  25.57 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  24.71 
 
 
172 aa  42  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  26.7 
 
 
189 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  26.37 
 
 
192 aa  41.2  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  26.79 
 
 
185 aa  40.8  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  24.14 
 
 
195 aa  41.2  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>