More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1006 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  100 
 
 		 389 aa  791    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0956  GTPase ObgE  90.23 
 
 		 386 aa  614  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0871  GTPase ObgE  87.09 
 
 		 387 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0184633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0854  GTPase ObgE  87.15 
 
 		 387 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000429069  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0969  GTPase ObgE  83.79 
 
 		 389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00013573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3321  GTPase ObgE  83.79 
 
 		 389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000481857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1071  GTPase ObgE  83.79 
 
 		 389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00003897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1038  GTPase ObgE  83.79 
 
 		 389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000432526  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2925  GTPase ObgE  82.92 
 
 		 388 aa  568  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231295  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3087  GTPase ObgE  81.42 
 
 		 388 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0897  GTPase ObgE  82.97 
 
 		 388 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00842399  normal  0.946957 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3123  GTPase ObgE  82.97 
 
 		 388 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3217  GTPase ObgE  82.97 
 
 		 388 aa  567  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000011291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0981  GTPase ObgE  83.85 
 
 		 388 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00015516  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3649  GTPase ObgE  81.28 
 
 		 388 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2827  GTPase ObgE  79.95 
 
 		 389 aa  511  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00452464  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  73.83 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  70.96 
 
 		 392 aa  481  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0527  GTPase ObgE  69.06 
 
 		 386 aa  474  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  67.41 
 
 		 392 aa  461  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  67.69 
 
 		 390 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  67.69 
 
 		 390 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  67.69 
 
 		 390 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  67.69 
 
 		 390 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  67.69 
 
 		 390 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  65.94 
 
 		 392 aa  455  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4510  GTPase ObgE  71.23 
 
 		 387 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001671  GTP-binding protein Obg  66.57 
 
 		 391 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000343056  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2855  GTPase ObgE  65.36 
 
 		 395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000349951  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  66.48 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  66.48 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0363  GTPase ObgE  65.85 
 
 		 392 aa  448  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0223104  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  65.55 
 
 		 390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  65.55 
 
 		 390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0476  GTPase ObgE  67.51 
 
 		 390 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000104171  normal  0.949161 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  65.55 
 
 		 390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3357  GTPase ObgE  65.48 
 
 		 392 aa  441  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0207536  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00802  GTPase ObgE  66.57 
 
 		 391 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03048  GTPase involved in cell partioning and DNA repair  66.48 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00301118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  65.36 
 
 		 391 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3376  GTPase ObgE  66.48 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3668  GTPase ObgE  66.48 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139354  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  66.02 
 
 		 390 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3479  GTPase ObgE  66.48 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000528393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0517  GTPase ObgE  66.48 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000402809  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3587  GTPase ObgE  66.48 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000763921  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02999  hypothetical protein  66.48 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  65.83 
 
 		 390 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  65.77 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  65.47 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  65.77 
 
 		 408 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  65.61 
 
 		 397 aa  431  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  65.77 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  66.07 
 
 		 407 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  63.38 
 
 		 402 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  65.47 
 
 		 407 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  64.86 
 
 		 407 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  64.86 
 
 		 405 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  63.77 
 
 		 406 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  64.07 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  64.26 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.08 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  64.37 
 
 		 347 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  60.66 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  64.07 
 
 		 339 aa  396  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  61.89 
 
 		 345 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  60 
 
 		 341 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  60.29 
 
 		 341 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  60.58 
 
 		 345 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  64.2 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  63.77 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  62.76 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  62.76 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  62.76 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  62.76 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  60.3 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  62.76 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  62.16 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  61.86 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  60.61 
 
 		 405 aa  381  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  62.76 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  62.76 
 
 		 372 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  62.76 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  63.8 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  60.12 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  60.42 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  64.81 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.18 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  61.11 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  59.88 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  61.19 
 
 		 373 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  60.12 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  59.82 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  61.93 
 
 		 365 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  60 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  59.21 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  59.52 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  61.19 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00015  GTPase ObgE  62.02 
 
 		 350 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178881  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  60.48 
 
 		 353 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>