30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0910 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0910  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  549  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596498  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3510  hypothetical protein  74.34 
 
 
267 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178381  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3846  hypothetical protein  59.53 
 
 
261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2972  hypothetical protein  58.08 
 
 
260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225401  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3180  hypothetical protein  57.98 
 
 
261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0594296  normal  0.121226 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0786  hypothetical protein  57.98 
 
 
261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3558  hypothetical protein  56.92 
 
 
261 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00233545  normal  0.0372974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0758  hypothetical protein  57.98 
 
 
261 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0270421  normal  0.286638 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3749  hypothetical protein  56.92 
 
 
261 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.511212  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0790  hypothetical protein  56.54 
 
 
261 aa  299  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0684  hypothetical protein  56.54 
 
 
261 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00404741  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3626  hypothetical protein  56.81 
 
 
261 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3178  hypothetical protein  56.32 
 
 
261 aa  296  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0841  hypothetical protein  51.39 
 
 
259 aa  249  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0847  hypothetical protein  42.86 
 
 
259 aa  188  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000167513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02113  hypothetical protein  42.5 
 
 
256 aa  178  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003702  hypothetical protein  40.08 
 
 
259 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.354988  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2632  hypothetical protein  38.65 
 
 
253 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.535591  normal  0.96162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0854  hypothetical protein  40 
 
 
256 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49781  predicted protein  25.41 
 
 
418 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  30.17 
 
 
1106 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  32.32 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  31.3 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  28.28 
 
 
250 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  28.12 
 
 
247 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  35.16 
 
 
269 aa  45.8  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47724  predicted protein  30.49 
 
 
646 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  21.28 
 
 
439 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  33.04 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  24.75 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>