More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0907 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
207 aa  424  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  86.47 
 
 
207 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  80.58 
 
 
207 aa  346  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.45 
 
 
211 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  68.66 
 
 
210 aa  293  9e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.66 
 
 
210 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.66 
 
 
210 aa  292  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.66 
 
 
210 aa  292  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.15 
 
 
209 aa  289  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.15 
 
 
209 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.16 
 
 
209 aa  287  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  64.11 
 
 
214 aa  278  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.69 
 
 
227 aa  266  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.55 
 
 
205 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  37.56 
 
 
210 aa  157  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.56 
 
 
210 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.27 
 
 
205 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.97 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.24 
 
 
205 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  41.97 
 
 
205 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  41.21 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  36 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  37.81 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0408  glutathione S-transferase-like  36.36 
 
 
200 aa  118  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.53035  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2769  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  36 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0042  glutathione S-transferase-like  34.33 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.422861 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  36 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  35.41 
 
 
222 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  36 
 
 
214 aa  111  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  35.5 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.49 
 
 
200 aa  108  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.02 
 
 
202 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  31.53 
 
 
202 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  35.03 
 
 
222 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  35.29 
 
 
181 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  37.68 
 
 
198 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.54 
 
 
219 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  31.37 
 
 
215 aa  104  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.35 
 
 
213 aa  104  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.02 
 
 
219 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0359  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 
201 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00589351  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  33.18 
 
 
216 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.52 
 
 
211 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0054  glutathione S-transferase like protein  37.5 
 
 
196 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000644124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  31.16 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.68 
 
 
217 aa  99  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 
211 aa  99  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.35 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  34.03 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  34.5 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  28.11 
 
 
216 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  31.28 
 
 
216 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  31.03 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  31.44 
 
 
214 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  30.81 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  32.04 
 
 
184 aa  95.9  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 
210 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  30 
 
 
216 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  31.55 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2358  Glutathione S-transferase domain protein  30.1 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.426471  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  31.55 
 
 
201 aa  94  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.8 
 
 
213 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  34.1 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  33.17 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  32.09 
 
 
213 aa  92  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 
206 aa  91.3  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  30.24 
 
 
214 aa  91.3  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  31.63 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  30.69 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.16 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  28.99 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.57 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  29.9 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  32.23 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.55 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  30.63 
 
 
221 aa  88.6  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3528  glutathione S-transferase  30.41 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0513  Glutathione S-transferase domain protein  29.68 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.1 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  32.09 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  30.99 
 
 
208 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  29.33 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  32.69 
 
 
204 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  30.43 
 
 
221 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  28.95 
 
 
211 aa  85.1  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.49 
 
 
235 aa  84.7  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  31.73 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  28.71 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.15 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0769  glutathione S-transferase  30.67 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  29.23 
 
 
219 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  31.73 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  31.73 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>