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for query gene Swoo_0897 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  58.98 
 
 		 577 aa  691    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.63 
 
 		 577 aa  686    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.84 
 
 		 569 aa  672    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  58.8 
 
 		 577 aa  688    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0895  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  89.2 
 
 		 574 aa  1042    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4094  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.83 
 
 		 584 aa  685    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3310  ssDNA exonuclease RecJ  57.09 
 
 		 577 aa  659    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.24828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.78 
 
 		 580 aa  650    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0772  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  80.77 
 
 		 574 aa  956    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167693  hitchhiker  0.00446395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  79.62 
 
 		 574 aa  952    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.12 
 
 		 569 aa  662    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  58.63 
 
 		 577 aa  686    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  57.64 
 
 		 571 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  56.94 
 
 		 577 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.83 
 
 		 571 aa  684    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  57.12 
 
 		 577 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  58.8 
 
 		 577 aa  687    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  56.67 
 
 		 569 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0564  ssDNA exonuclease RecJ  60.07 
 
 		 579 aa  699    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.755584  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0863  ssDNA exonuclease RecJ  56.45 
 
 		 584 aa  659    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  56.92 
 
 		 577 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0897  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 574 aa  1177    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3302  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.52 
 
 		 572 aa  654    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.117483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.02 
 
 		 569 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3447  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  81.01 
 
 		 574 aa  969    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  58.8 
 
 		 577 aa  686    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  56.92 
 
 		 577 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  57.82 
 
 		 577 aa  677    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3641  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  80.49 
 
 		 577 aa  964    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  58.16 
 
 		 579 aa  701    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  56.94 
 
 		 577 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3522  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  80.66 
 
 		 577 aa  965    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  57.12 
 
 		 577 aa  672    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.333614 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3760  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.09 
 
 		 610 aa  671    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.671236 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  54.83 
 
 		 581 aa  644    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.02 
 
 		 569 aa  670    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0749  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  74.74 
 
 		 574 aa  889    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0015193  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  58.98 
 
 		 577 aa  691    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.02 
 
 		 569 aa  673    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  56.92 
 
 		 577 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  58.8 
 
 		 577 aa  688    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1993  ssDNA exonuclease RecJ  58.68 
 
 		 584 aa  700    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39440  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.27 
 
 		 569 aa  646    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.47 
 
 		 572 aa  664    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_0647  ssDNA exonuclease RecJ  55.94 
 
 		 584 aa  651    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.252802  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1474  single-strand DNA-specific exonuclease  56.92 
 
 		 573 aa  641    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3376  exonuclease RecJ  58.35 
 
 		 569 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.593595 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  79.97 
 
 		 574 aa  951    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3226  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  80.14 
 
 		 574 aa  953    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0665  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  79.44 
 
 		 574 aa  919    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0729862  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.19 
 
 		 571 aa  688    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  81.99 
 
 		 574 aa  982    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0845  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  80.84 
 
 		 577 aa  966    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  58.8 
 
 		 577 aa  686    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2737  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  72.95 
 
 		 574 aa  874    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.22 
 
 		 576 aa  685    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.68 
 
 		 579 aa  710    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_3329  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  79.97 
 
 		 574 aa  952    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  56.92 
 
 		 577 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0892  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  80.49 
 
 		 584 aa  957    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.488933  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_03407  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.26 
 
 		 573 aa  629  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_2272  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.51 
 
 		 577 aa  619  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.57 
 
 		 574 aa  601  1e-170  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_1460  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.26 
 
 		 574 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  51.57 
 
 		 574 aa  600  1e-170  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.55 
 
 		 579 aa  582  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.73 
 
 		 579 aa  584  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1819  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.08 
 
 		 577 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  53.44 
 
 		 566 aa  554  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1189  RecJ exonuclease  51.3 
 
 		 574 aa  548  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2065  exonuclease RecJ  52.74 
 
 		 564 aa  541  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1771  exonuclease RecJ  51.62 
 
 		 565 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.722264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.8 
 
 		 563 aa  532  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA0628  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.31 
 
 		 599 aa  522  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  50.81 
 
 		 566 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  49.37 
 
 		 565 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0150  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.95 
 
 		 575 aa  504  1e-141  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.111864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5406  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.94 
 
 		 572 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2758  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.27 
 
 		 574 aa  501  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0640  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.5 
 
 		 613 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_00083  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.11 
 
 		 558 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.491155  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2026  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.64 
 
 		 565 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1448  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.01 
 
 		 577 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1564  RecJ exonuclease  49.73 
 
 		 568 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373395  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2153  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.64 
 
 		 565 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000147893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1154  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.01 
 
 		 565 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1698  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.92 
 
 		 564 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.92 
 
 		 564 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.78 
 
 		 573 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.27 
 
 		 574 aa  488  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3113  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.92 
 
 		 564 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2205  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.92 
 
 		 564 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1478  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.92 
 
 		 564 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2642  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.92 
 
 		 564 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2569  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.37 
 
 		 568 aa  485  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217652  normal  0.0265746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease protein  49.37 
 
 		 565 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00151931  normal  0.274168 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0122  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.81 
 
 		 578 aa  485  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.99 
 
 		 564 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214774  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1817  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.06 
 
 		 585 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0771206 
 
 
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NC_009074  BURPS668_2588  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.92 
 
 		 564 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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