134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0750 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  73.15 
 
 		 298 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  62.42 
 
 		 298 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  31.42 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  31.29 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6874  Flp pilus assembly protein CpaB  28.81 
 
 		 366 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.367067  normal  0.327856 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  32.48 
 
 		 234 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  32.2 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  29.26 
 
 		 286 aa  95.9  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  28.32 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  30.81 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  26.91 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  27.32 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  28 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  27.32 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  27.39 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  24.3 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  27.5 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  25.68 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  26.7 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  26.7 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  26.7 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  26.21 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  26.05 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  27.18 
 
 		 233 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  23.58 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  24.68 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  23.58 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  23.58 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  26.12 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  27.9 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  23.72 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  24.55 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  23.17 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  25.13 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  25.25 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  25.11 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  23.14 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  23.98 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  27.17 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  33.61 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  26.64 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  25.86 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  26.04 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02596  signal peptide protein  29.66 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  24.88 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  26.04 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  27.23 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  24.18 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  25 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  29.41 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  24.52 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  22.73 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  34.38 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  22.87 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  29.37 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  30.13 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  28.15 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  24.5 
 
 		 266 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  30.92 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  27.27 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  28.19 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  25.77 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  28.33 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  25 
 
 		 345 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  27.75 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  26.92 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  23.57 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  22.84 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  25.1 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  25.63 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  25 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  28.09 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  25 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  25.22 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  22.41 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  24.4 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  23.91 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  23.91 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  23.91 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  26.96 
 
 		 261 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  23.91 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  23.91 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  23.91 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  23.41 
 
 		 263 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  23.18 
 
 		 319 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  24.49 
 
 		 332 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  22.47 
 
 		 287 aa  52.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  26.53 
 
 		 316 aa  52.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  26.94 
 
 		 338 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  23.45 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  23.73 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  25.91 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  26.99 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  26.32 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  25.74 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  25.74 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  25.74 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  25.32 
 
 		 300 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>