135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0731 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0731  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  525  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3829  putative ABC transport system permease protein  76.83 
 
 		 263 aa  378  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000396404 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2942  hypothetical protein  62.75 
 
 		 256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01854  hypothetical protein  54.65 
 
 		 266 aa  297  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003828  ABC-type uncharacterized transport system permease component  54.07 
 
 		 270 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0630  hypothetical protein  59.92 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0826  membrane protein  55.91 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.293934  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0169  ABC transporter, permease protein, putative  43.1 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645871  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1145  ABC transporter, inner membrane subunit  36.9 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000431161  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1858  putative ABC transport system permease protein  35.04 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0986378  normal  0.82732 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0214  hypothetical protein  33.07 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.458812  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2007  ABC-type transport system, permease component  41.09 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  34.3 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  35.47 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4760  hypothetical protein  33.6 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  35.44 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  37.12 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3073  hypothetical protein  37.4 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  32.11 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0080  ABC transporter permease  31.14 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  33.2 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1835  hypothetical protein  39.71 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  36.82 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  33.94 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3633  hypothetical protein  31.54 
 
 		 265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  32.53 
 
 		 265 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5079  hypothetical protein  31.62 
 
 		 265 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5084  hypothetical protein  31.62 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5081  hypothetical protein  31.62 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0161  hypothetical protein  31.23 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4653  hypothetical protein  31.23 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5050  hypothetical protein  31.23 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4673  hypothetical protein  31.23 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  33.03 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2020  hypothetical protein  36.73 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  36.89 
 
 		 266 aa  125  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4811  hypothetical protein  30.8 
 
 		 265 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5176  hypothetical protein  30.8 
 
 		 265 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0767  hypothetical protein  35.65 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  29.2 
 
 		 264 aa  121  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15630  conserved hypothetical protein TIGR00245  36.15 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  30.94 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  35.98 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  29.88 
 
 		 262 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  31.88 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  30.22 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  32.02 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  35.98 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  31.33 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000207096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  31.33 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000302353  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0748  hypothetical protein  33.2 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  32.46 
 
 		 251 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000359378  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2410  hypothetical protein  33.92 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  29.78 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  30.67 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  29.78 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1799  hypothetical protein  29.78 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  35.62 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1437  hypothetical protein  37.71 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318799  normal  0.0549134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  30.67 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  34.13 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  34.13 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  34.13 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  34.13 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  34.13 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  34.13 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  34.13 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  32.64 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2239  hypothetical protein  36.11 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255232  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7995  hypothetical protein  36.11 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2266  hypothetical protein  32.47 
 
 		 272 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0986  hypothetical protein  32.85 
 
 		 268 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2290  hypothetical protein  34.31 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000247425 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0076  hypothetical protein  29.5 
 
 		 269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0298659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1863  hypothetical protein  30.04 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00500964  normal  0.0941942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0700  hypothetical protein  29.67 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1234  hypothetical protein  28.63 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2104  hypothetical protein  33.63 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1309  hypothetical protein  30.8 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1058  hypothetical protein  29.41 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0072  hypothetical protein  34.47 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0198  hypothetical protein  33.65 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.68555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  35.81 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  32.52 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2323  ABC transporter, inner membrane subunit  29.96 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2859  hypothetical protein  36.11 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1176  hypothetical protein  32.77 
 
 		 234 aa  105  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3122  hypothetical protein  29.5 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.859294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1097  hypothetical protein  30.45 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215237  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0121  hypothetical protein  33.97 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1218  hypothetical protein  30.32 
 
 		 258 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1171  hypothetical protein  31.03 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.937422 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15102  predicted protein  34.35 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0934  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.6 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000794066  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1504  hypothetical protein  30.7 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2037  hypothetical protein  28.77 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1378  hypothetical protein  30.19 
 
 		 242 aa  96.7  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0154277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4093  hypothetical protein  31.03 
 
 		 238 aa  95.9  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0165  hypothetical protein  32.89 
 
 		 266 aa  95.5  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.980165  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  29.88 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>