More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0716 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3844  phosphate transporter  91.23 
 
 
422 aa  755  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  6.89956e-07  hitchhiker  3.51014e-08 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  84.52 
 
 
429 aa  703  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.38247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  79.29 
 
 
422 aa  661  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0566  phosphate transporter  86.02 
 
 
422 aa  676  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  86.9 
 
 
429 aa  717  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  6.95e-06  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  86.9 
 
 
429 aa  717  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  6.58965e-08  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0882  phosphate transporter  87.38 
 
 
429 aa  730  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.02978e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0691  phosphate transporter  86.26 
 
 
422 aa  702  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  7.5079e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  100 
 
 
422 aa  825  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.46128e-07  unclonable  1.5476e-08 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0916  phosphate transporter  87.38 
 
 
429 aa  730  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  7.85121e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  85.24 
 
 
424 aa  712  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0821  phosphate transporter  86.43 
 
 
429 aa  715  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.02256e-07  normal  0.247427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2674  phosphate transporter  85.27 
 
 
423 aa  694  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00487764  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  89.57 
 
 
422 aa  722  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  3.39536e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0906  phosphate transporter  87.38 
 
 
429 aa  730  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.84742e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3456  phosphate transporter  87.38 
 
 
429 aa  730  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  6.64139e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  89.57 
 
 
422 aa  742  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03147  Phosphate permease  75.66 
 
 
423 aa  607  1e-172  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0428562  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0180  phosphate transporter  74.82 
 
 
421 aa  601  1e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3637  phosphate transporter family protein  72.85 
 
 
431 aa  595  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2020  pho4 family protein  67.14 
 
 
433 aa  557  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.35639e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004529  probable low-affinity inorganic phosphate transporter  66.67 
 
 
419 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000555877  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00862  hypothetical protein  66.27 
 
 
419 aa  552  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2682  putative phosphate transporter  66.11 
 
 
428 aa  548  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0352  phosphate transporter  64.58 
 
 
423 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2469  phosphate transporter  64.83 
 
 
423 aa  517  1e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1191  phosphate permease  63.46 
 
 
420 aa  500  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68780  phosphate transporter  60.19 
 
 
422 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0229  phosphate transporter  59.29 
 
 
422 aa  487  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0137  low-affinity inorganic phosphate transporter  57.73 
 
 
417 aa  480  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2189  phosphate transporter family protein  57.25 
 
 
417 aa  476  1e-133  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5952  phosphate transporter  59.46 
 
 
422 aa  466  1e-130  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0142  phosphate transporter  59.76 
 
 
418 aa  454  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.983377  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0712  phosphate transporter  60.48 
 
 
423 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2826  phosphate transporter  59.17 
 
 
418 aa  413  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1053  phosphate transporter  58.72 
 
 
416 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.036629  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0617  hypothetical protein  47.88 
 
 
417 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0633  hypothetical protein  47.88 
 
 
417 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  43.31 
 
 
411 aa  337  2e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0492  phosphate transporter  41.85 
 
 
401 aa  316  6e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  2.295e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  43.69 
 
 
397 aa  312  9e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0663  phosphate transporter  43.75 
 
 
402 aa  306  5e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.43289e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0687  phosphate transporter  42.82 
 
 
402 aa  305  9e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  1.46825e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  41.59 
 
 
411 aa  295  9e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0543  phosphate transporter  44.47 
 
 
523 aa  276  7e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0064  phosphate permease family protein  42.82 
 
 
426 aa  270  3e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3724  phosphate transporter  41.67 
 
 
429 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3225  phosphate transporter  40.78 
 
 
411 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0155  phosphate transporter  38.16 
 
 
461 aa  253  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610191  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1957  phosphate transporter family protein  33.87 
 
 
514 aa  249  5e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3122  phosphate permease  41.24 
 
 
514 aa  249  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.669581  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0842  phosphate transporter  37.29 
 
 
505 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0133767  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3279  phosphate transporter  41.46 
 
 
524 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.854272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2170  inorganic phosphate transporter  37.29 
 
 
505 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2323  phosphate transporter  37.32 
 
 
504 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0503  phosphate transporter  41.19 
 
 
549 aa  241  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2034  phosphate transporter  41.73 
 
 
498 aa  240  3e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1333  phosphate transporter  39.22 
 
 
520 aa  232  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383309  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42057  PiT family transporter: phosphate  33.97 
 
 
538 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.870144  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0542  phosphate transporter  40.05 
 
 
542 aa  229  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3586  phosphate transporter  39.25 
 
 
521 aa  229  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1670  phosphate transporter  42.44 
 
 
526 aa  229  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0608  phosphate transporter  37.27 
 
 
494 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0822433  normal  0.70897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0389  phosphate transporter  34.78 
 
 
501 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.797462 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1850  phosphate transporter  42.55 
 
 
535 aa  224  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0487  phosphate transporter  36.52 
 
 
499 aa  221  2e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306964  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0900  phosphate transporter  39.23 
 
 
502 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.177688 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5782  phosphate permease  39.06 
 
 
500 aa  217  3e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0443  phosphate transporter  39.62 
 
 
499 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0665  phosphate transporter  38.83 
 
 
494 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393628  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0667  phosphate transporter  37.6 
 
 
496 aa  206  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  48 
 
 
346 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  9.73225e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0634  phosphate transporter  35 
 
 
474 aa  163  5e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0419922  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23830  predicted protein  47.62 
 
 
497 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028524  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08680  phosphate/sulfate permease  47.93 
 
 
599 aa  152  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.093413  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0691  phosphate transporter  45.99 
 
 
535 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0716  inorganic phosphate transporter  45.45 
 
 
535 aa  150  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0400057  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1966  phosphate transporter  28.99 
 
 
391 aa  148  2e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0416469 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0788  phosphate transporter  34.27 
 
 
535 aa  147  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119536  high affinity phosphate transporter, probable  40.78 
 
 
600 aa  143  6e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0681687  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0682  phosphate transporter family protein  45.98 
 
 
516 aa  142  1e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0929  putative phosphate-transport permease PitB  45.3 
 
 
506 aa  142  1e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1218  phosphate transporter family protein  31.89 
 
 
512 aa  142  1e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.5175  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00270  phosphate/sulfate permease  37.65 
 
 
539 aa  140  4e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1129  phosphate-transport permease PitB  35.29 
 
 
522 aa  140  6e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.371556  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1209  phosphate transporter family protein  42.93 
 
 
508 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1328  phosphate transporter family protein  42.93 
 
 
508 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1038  phosphate transporter  30.53 
 
 
394 aa  137  3e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0998  hypothetical protein  29.22 
 
 
399 aa  137  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.06049  normal  0.558836 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0535  phosphate transporter family protein  41.85 
 
 
508 aa  135  1e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.90245  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10343  phosphate-repressible Na+/phosphate cotransporter Pho89, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03010)  38.61 
 
 
580 aa  134  2e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0889794  normal  0.570807 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  30 
 
 
338 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1021  phosphate transporter  27.25 
 
 
391 aa  133  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.335253 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1631  phosphate transporter  33.59 
 
 
521 aa  133  7e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05450  sodium:inorganic phosphate symporter, putative  39.23 
 
 
596 aa  126  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12304  phosphate-transport system permease pitB  35.08 
 
 
552 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11011  conserved hypothetical protein  40.12 
 
 
558 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.677966 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66490  Na+/Pi symporter  34.85 
 
 
582 aa  120  4e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.602489  normal  0.0911162 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08956  phosphate-repressible phosphate permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01850)  42.42 
 
 
571 aa  119  8e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  27.74 
 
 
336 aa  114  4e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>