More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0663 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0663  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
259 aa  532  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.38554e-08  hitchhiker  0.000142702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3872  Sel1 domain-containing protein  78.99 
 
 
258 aa  424  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000147421  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3746  Sel1 domain-containing protein  67.32 
 
 
259 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0579  Sel1 domain-containing protein  66.93 
 
 
259 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171088  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3689  Sel1 domain protein repeat-containing protein  66.54 
 
 
259 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.292341  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3872  Sel1 domain-containing protein  66.15 
 
 
259 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3411  Sel1 domain-containing protein  62.93 
 
 
259 aa  362  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.001433  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0618  Sel1 domain-containing protein  62.93 
 
 
259 aa  362  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.51187e-05  normal  0.335089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0619  Sel1 domain-containing protein  62.93 
 
 
259 aa  361  7e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0168047  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0625  hypothetical protein  62.65 
 
 
259 aa  359  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3508  Sel1 domain-containing protein  65.25 
 
 
260 aa  353  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00034309  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0653  hypothetical protein  63.04 
 
 
259 aa  352  3e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0586  TPR repeat-containing protein  70.46 
 
 
259 aa  347  9e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440919  normal  0.522989 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3291  TPR repeat-containing protein  60.89 
 
 
259 aa  324  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3003  hypothetical protein  58.14 
 
 
258 aa  318  4e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.80512e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3189  Sel1-like protein  61.34 
 
 
265 aa  306  2e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  2.70269e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  29.8 
 
 
260 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  38.39 
 
 
831 aa  79.3  5e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  38.68 
 
 
789 aa  77.4  2e-13  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  30.48 
 
 
684 aa  77.4  2e-13  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.93 
 
 
305 aa  76.6  3e-13  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  39.42 
 
 
245 aa  76.6  4e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.12 
 
 
425 aa  76.3  5e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.88 
 
 
416 aa  76.3  5e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  35.59 
 
 
961 aa  75.9  6e-13  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.53 
 
 
557 aa  75.9  6e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.85463e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  32.39 
 
 
255 aa  75.5  7e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  40.35 
 
 
185 aa  75.1  9e-13  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.1 
 
 
1402 aa  74.7  1e-12  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.24156e-07 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  38.05 
 
 
181 aa  73.6  3e-12  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 
303 aa  73.6  3e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.47126e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  36.43 
 
 
325 aa  73.2  4e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  38.6 
 
 
393 aa  72.8  5e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.64549e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  35.88 
 
 
271 aa  72.8  6e-12  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36 
 
 
325 aa  71.6  1e-11  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  36 
 
 
285 aa  71.2  1e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  36 
 
 
325 aa  71.6  1e-11  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  36.61 
 
 
1493 aa  70.9  2e-11  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.74 
 
 
528 aa  70.1  3e-11  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  26.21 
 
 
331 aa  69.7  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  28.83 
 
 
235 aa  68.9  7e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  35.2 
 
 
327 aa  68.9  7e-11  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.61 
 
 
489 aa  68.9  8e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  37.74 
 
 
2413 aa  68.2  1e-10  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
976 aa  67.4  2e-10  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.91 
 
 
255 aa  67  3e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  34.19 
 
 
731 aa  66.6  4e-10  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.88 
 
 
318 aa  66.2  5e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  31.9 
 
 
232 aa  66.2  5e-10  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0800  Sel1 repeat-containing protein  37.17 
 
 
252 aa  66.2  5e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.68 
 
 
346 aa  66.2  5e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  26.4 
 
 
331 aa  66.2  5e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 
172 aa  65.9  6e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.69346e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 
448 aa  65.9  6e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30.82 
 
 
1037 aa  65.5  7e-10  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  38.04 
 
 
236 aa  65.5  8e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  26.4 
 
 
331 aa  65.5  9e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  37.74 
 
 
208 aa  65.1  1e-09  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  29.73 
 
 
1877 aa  65.1  1e-09  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.58 
 
 
132 aa  64.7  1e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  30.16 
 
 
838 aa  65.1  1e-09  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.09 
 
 
256 aa  64.3  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.21 
 
 
490 aa  64.3  2e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  37.36 
 
 
233 aa  64.3  2e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  32.79 
 
 
331 aa  63.5  3e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  35.78 
 
 
359 aa  63.5  3e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  37.5 
 
 
1002 aa  63.5  3e-09  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  33.91 
 
 
685 aa  63.2  4e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  35.51 
 
 
978 aa  63.2  4e-09  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 
1430 aa  63.5  4e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  37.89 
 
 
267 aa  63.2  4e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  32.74 
 
 
255 aa  63.2  4e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.26 
 
 
234 aa  63.2  4e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.06 
 
 
341 aa  62.8  6e-09  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  32.74 
 
 
258 aa  62.8  6e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  31.58 
 
 
765 aa  62.8  6e-09  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
258 aa  62.8  6e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  24.88 
 
 
376 aa  62.8  6e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 
252 aa  62.4  7e-09  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.53 
 
 
380 aa  62.4  7e-09  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  31.21 
 
 
490 aa  62.4  7e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  32.74 
 
 
258 aa  62  8e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  33.61 
 
 
329 aa  62.4  8e-09  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  34.38 
 
 
117 aa  62.4  8e-09  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  36.79 
 
 
264 aa  61.2  1e-08  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.87 
 
 
126 aa  62  1e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  32.14 
 
 
258 aa  61.2  1e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.67 
 
 
211 aa  61.6  1e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  2.52164e-05  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  33.91 
 
 
720 aa  60.5  2e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  31.78 
 
 
218 aa  60.5  2e-08  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  29.79 
 
 
913 aa  60.8  2e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  33.91 
 
 
720 aa  60.8  2e-08  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  1.24108e-06 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 
482 aa  60.8  2e-08  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  33.91 
 
 
720 aa  60.8  2e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  34.11 
 
 
839 aa  60.1  3e-08  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  39.18 
 
 
241 aa  60.5  3e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 
250 aa  60.1  3e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  30.72 
 
 
523 aa  60.5  3e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58600  hypothetical protein  38.95 
 
 
271 aa  59.7  4e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.48 
 
 
1196 aa  60.1  4e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>