32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0661 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  223  5e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  7.89332e-09  hitchhiker  2.6352e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  73.21 
 
 
112 aa  166  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.39506e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3874  hypothetical protein  60.19 
 
 
115 aa  129  1e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000309341  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3748  hypothetical protein  60.19 
 
 
115 aa  129  1e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0891426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3691  hypothetical protein  60.19 
 
 
115 aa  129  1e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272245  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0577  hypothetical protein  60.19 
 
 
115 aa  129  1e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00197884  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0651  hypothetical protein  59.22 
 
 
115 aa  127  4e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.88562e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0623  hypothetical protein  57.66 
 
 
115 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0617  hypothetical protein  59.22 
 
 
115 aa  123  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000242002  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0616  hypothetical protein  59.22 
 
 
115 aa  123  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  4.14361e-06  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3413  hypothetical protein  59.22 
 
 
115 aa  123  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000138823  normal  0.329766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3005  hypothetical protein  54.55 
 
 
114 aa  116  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000355724  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0584  hypothetical protein  57.14 
 
 
112 aa  110  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00300104  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  55.95 
 
 
102 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.34478e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3293  hypothetical protein  43.27 
 
 
116 aa  90.5  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196419  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30.43 
 
 
103 aa  50.4  7e-06  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  31.75 
 
 
106 aa  49.7  1e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  34.78 
 
 
105 aa  50.1  1e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  31.4 
 
 
114 aa  49.3  2e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  31.82 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  30.3 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.71334e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  30.3 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  30.3 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36946e-09 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  30.3 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30.3 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.25989e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  30.3 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  25 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  30.65 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5574  hypothetical protein  25.37 
 
 
101 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185184  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  29.69 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  31.91 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25 
 
 
105 aa  40  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>