73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0646 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  100 
 
 
143 aa  280  5e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  1.39477e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  55.24 
 
 
139 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  55.56 
 
 
139 aa  139  1e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  54.86 
 
 
139 aa  138  2e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  54.86 
 
 
139 aa  138  2e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  54.17 
 
 
139 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  61.4 
 
 
139 aa  134  3e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  53.47 
 
 
142 aa  133  7e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  58.26 
 
 
139 aa  127  4e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  57.39 
 
 
139 aa  127  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  47.29 
 
 
144 aa  113  8e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  52.63 
 
 
139 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  32.12 
 
 
154 aa  60.1  1e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  34.29 
 
 
157 aa  56.6  1e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  41 
 
 
578 aa  55.8  2e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  46.84 
 
 
178 aa  55.8  2e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  33.33 
 
 
156 aa  53.5  8e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01502  minor curlin subunit CsgB, putative  44.21 
 
 
170 aa  53.1  1e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  33.33 
 
 
157 aa  52.4  2e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  36.67 
 
 
170 aa  52  3e-06  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  34.29 
 
 
151 aa  52  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  33.33 
 
 
157 aa  51.6  3e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  34.29 
 
 
151 aa  51.6  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  34.29 
 
 
151 aa  51.6  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  34.29 
 
 
151 aa  51.6  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  34.29 
 
 
151 aa  51.6  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2415  curlin-associated protein  24.86 
 
 
190 aa  51.2  4e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  35.24 
 
 
160 aa  48.5  3e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  35.24 
 
 
160 aa  48.5  3e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  35.24 
 
 
151 aa  48.5  3e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  35.24 
 
 
160 aa  48.5  3e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  35.24 
 
 
151 aa  48.5  3e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  35.24 
 
 
151 aa  48.5  3e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  35.24 
 
 
151 aa  48.5  3e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  35.24 
 
 
151 aa  48.5  3e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  29.73 
 
 
144 aa  48.1  4e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2557  cryptic curlin major subunit  33.72 
 
 
151 aa  47.8  5e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.363061 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01039  cryptic curlin major subunit  33.72 
 
 
151 aa  47.8  5e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2603  cryptic curlin major subunit  33.72 
 
 
151 aa  47.8  5e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.761097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1161  cryptic curlin major subunit  33.72 
 
 
151 aa  47.8  5e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.401607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01046  hypothetical protein  33.72 
 
 
151 aa  47.8  5e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1162  cryptic curlin major subunit  33.72 
 
 
151 aa  47.8  5e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.596928  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  36 
 
 
552 aa  47.4  7e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  31.87 
 
 
183 aa  47  9e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1422  cryptic curlin major subunit  32.56 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  33.9 
 
 
502 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  33.9 
 
 
502 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  37.5 
 
 
496 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  37.25 
 
 
502 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  30.41 
 
 
453 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  37.5 
 
 
496 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  35.64 
 
 
627 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1558  cryptic curlin major subunit  31.4 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  37.5 
 
 
496 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  38.82 
 
 
483 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2089  cryptic curlin major subunit  32.56 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.226612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1255  cryptic curlin major subunit  34.88 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.662472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1210  cryptic curlin major subunit  34.88 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.519836  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  41.33 
 
 
500 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1240  cryptic curlin major subunit  34.88 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2046  cryptic curlin major subunit  34.88 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00217142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2229  cryptic curlin major subunit  34.88 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  34.29 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  35.62 
 
 
517 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1513  curlin-associated protein  31.65 
 
 
177 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  37.97 
 
 
496 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  30.13 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  37.5 
 
 
496 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  38.96 
 
 
451 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  39.19 
 
 
481 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2730  putative minor curlin subunit precursor (fimbrin sef17 minor subunit)  36.26 
 
 
169 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  27.62 
 
 
503 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  2.77194e-08 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  34.91 
 
 
415 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>