65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0645 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  100 
 
 
503 aa  962  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  2.77194e-08 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  55.51 
 
 
502 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  53.98 
 
 
496 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  55.51 
 
 
502 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  56.05 
 
 
502 aa  509  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  54.38 
 
 
496 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  54.18 
 
 
496 aa  507  1e-142  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  53.98 
 
 
496 aa  505  1e-142  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  53.98 
 
 
496 aa  504  1e-142  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  53.68 
 
 
500 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  52.46 
 
 
498 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  37.42 
 
 
451 aa  200  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  36.84 
 
 
483 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  30.66 
 
 
453 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  31.71 
 
 
552 aa  94  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  27.39 
 
 
627 aa  82  2e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  26.56 
 
 
481 aa  69.7  1e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  27.61 
 
 
564 aa  65.9  2e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  29.74 
 
 
434 aa  65.5  2e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  27.3 
 
 
498 aa  63.9  6e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  25.74 
 
 
415 aa  63.9  7e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  29.82 
 
 
392 aa  63.5  8e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2864  curlin associated precursor, CsgA like  33.18 
 
 
314 aa  62.4  2e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.792578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  26.31 
 
 
481 aa  61.2  4e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  28.88 
 
 
483 aa  60.5  7e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  37.36 
 
 
151 aa  56.2  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  37.36 
 
 
151 aa  56.2  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  37.36 
 
 
151 aa  56.6  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  37.36 
 
 
151 aa  56.2  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  37.36 
 
 
151 aa  56.2  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  29.01 
 
 
517 aa  56.6  1e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  36.84 
 
 
144 aa  55.1  3e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  27.68 
 
 
482 aa  53.9  7e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  28.31 
 
 
457 aa  51.2  4e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4724  hypothetical protein  26.88 
 
 
470 aa  51.2  4e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  36.9 
 
 
139 aa  50.8  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  36.9 
 
 
139 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  36.9 
 
 
139 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  27.88 
 
 
444 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  30.77 
 
 
157 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  32.35 
 
 
139 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  35.71 
 
 
139 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  35.71 
 
 
139 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  32.97 
 
 
160 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  32.04 
 
 
139 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  32.76 
 
 
183 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2415  curlin-associated protein  33.33 
 
 
190 aa  47  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  31.87 
 
 
151 aa  47  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  31.87 
 
 
151 aa  47  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.361683 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  31.87 
 
 
151 aa  47  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  31.87 
 
 
151 aa  47  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  31.87 
 
 
151 aa  47  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  31.87 
 
 
160 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  31.87 
 
 
160 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  30.77 
 
 
157 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  36.9 
 
 
139 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  30 
 
 
156 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  31.2 
 
 
144 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0032  hypothetical protein  30.43 
 
 
214 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0801235 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  34.07 
 
 
151 aa  45.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  29.12 
 
 
170 aa  44.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  30 
 
 
157 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  31.15 
 
 
139 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  32.79 
 
 
183 aa  44.3  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  29.55 
 
 
241 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>