201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0577 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 2074 aa  4037    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  35.17 
 
 		 3927 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  32.89 
 
 		 4978 aa  397  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  34.79 
 
 		 5745 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.75 
 
 		 1884 aa  350  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.61 
 
 		 994 aa  311  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  31.86 
 
 		 3191 aa  290  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  31.6 
 
 		 3474 aa  277  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  31.41 
 
 		 1867 aa  267  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  36.4 
 
 		 1597 aa  261  7e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  39 
 
 		 892 aa  262  7e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  32.4 
 
 		 2816 aa  261  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.11 
 
 		 850 aa  247  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  28.18 
 
 		 1269 aa  243  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  28.22 
 
 		 1268 aa  238  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  32.14 
 
 		 4848 aa  233  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  28.5 
 
 		 1269 aa  231  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  31.01 
 
 		 2377 aa  230  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  31.53 
 
 		 3544 aa  226  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.73 
 
 		 3699 aa  219  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  29.31 
 
 		 3699 aa  217  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  35.08 
 
 		 2839 aa  213  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  28.38 
 
 		 16322 aa  186  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.79 
 
 		 3363 aa  186  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.47 
 
 		 2507 aa  184  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.39 
 
 		 2114 aa  184  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  31.41 
 
 		 9867 aa  180  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  27.56 
 
 		 1367 aa  179  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  27.39 
 
 		 1363 aa  173  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  26.54 
 
 		 2767 aa  167  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  29.88 
 
 		 4854 aa  166  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  31.01 
 
 		 7284 aa  161  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  24.95 
 
 		 2555 aa  154  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.64 
 
 		 4220 aa  154  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.24 
 
 		 761 aa  152  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  33.87 
 
 		 1428 aa  150  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  27.49 
 
 		 16311 aa  148  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  46.11 
 
 		 715 aa  146  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  30.57 
 
 		 1755 aa  140  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  29.14 
 
 		 3089 aa  137  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  28.79 
 
 		 1750 aa  134  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.78 
 
 		 369 aa  130  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  29.85 
 
 		 721 aa  127  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1512 aa  127  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.69 
 
 		 3816 aa  123  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.91 
 
 		 4122 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  30.5 
 
 		 1011 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  28.64 
 
 		 2522 aa  119  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  25.54 
 
 		 2145 aa  117  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  31.5 
 
 		 2476 aa  113  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  31.41 
 
 		 814 aa  112  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1879 aa  112  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  28.73 
 
 		 1631 aa  110  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  30.42 
 
 		 2503 aa  107  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  31.16 
 
 		 8918 aa  103  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  33.79 
 
 		 5094 aa  101  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.89 
 
 		 2812 aa  99.8  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  30.99 
 
 		 2233 aa  97.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.92 
 
 		 3396 aa  97.1  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  26.39 
 
 		 1779 aa  96.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  31.3 
 
 		 3477 aa  97.1  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.55 
 
 		 2807 aa  93.2  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  31.13 
 
 		 1394 aa  92  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  26.51 
 
 		 1408 aa  90.5  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  26.51 
 
 		 1410 aa  90.5  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  26.51 
 
 		 1410 aa  90.5  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  26.7 
 
 		 1141 aa  90.5  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.92 
 
 		 1109 aa  87.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  26.44 
 
 		 2127 aa  87.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.22 
 
 		 4836 aa  87  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  27.91 
 
 		 5769 aa  84  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  42.58 
 
 		 1908 aa  83.6  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  29.55 
 
 		 2353 aa  83.6  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  32.96 
 
 		 1416 aa  83.2  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  26.19 
 
 		 8321 aa  83.2  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1538 aa  80.9  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.06 
 
 		 1949 aa  79.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  26.09 
 
 		 4661 aa  79.3  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  42.11 
 
 		 2542 aa  78.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  30.57 
 
 		 1264 aa  77.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1699 aa  77.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  25.85 
 
 		 1422 aa  76.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  23.97 
 
 		 3244 aa  76.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  25.16 
 
 		 991 aa  76.3  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  35.34 
 
 		 1421 aa  75.5  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  32.16 
 
 		 2715 aa  74.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  31.8 
 
 		 1502 aa  73.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  29.54 
 
 		 722 aa  73.6  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  31.07 
 
 		 1911 aa  73.6  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  23.84 
 
 		 2079 aa  72.4  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  30.85 
 
 		 792 aa  71.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.95 
 
 		 4798 aa  71.2  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  27.22 
 
 		 3439 aa  69.3  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  25.93 
 
 		 998 aa  69.3  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  31.93 
 
 		 1712 aa  68.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.6 
 
 		 1215 aa  67.4  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  26.6 
 
 		 1215 aa  67  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  34.01 
 
 		 1987 aa  67  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  39.67 
 
 		 436 aa  66.6  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  28.41 
 
 		 6211 aa  66.2  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>