More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0516 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  83.61 
 
 		 909 aa  1560    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 909 aa  1852    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  60.66 
 
 		 896 aa  1118    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  35.56 
 
 		 872 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  34.94 
 
 		 800 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 891 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  34.73 
 
 		 869 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  35.43 
 
 		 876 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 868 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 882 aa  363  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 886 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 882 aa  362  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 886 aa  360  6e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 894 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 892 aa  354  5e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  29.69 
 
 		 899 aa  333  9e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  29.69 
 
 		 884 aa  331  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 883 aa  325  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 883 aa  325  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 883 aa  325  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 852 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 869 aa  315  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  29.37 
 
 		 895 aa  312  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  29.13 
 
 		 827 aa  311  4e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 875 aa  311  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 847 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 861 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 861 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 861 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 861 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 890 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 861 aa  303  9e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 857 aa  303  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 861 aa  303  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  28.63 
 
 		 839 aa  303  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  28.26 
 
 		 893 aa  301  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 842 aa  301  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 890 aa  301  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 843 aa  300  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 890 aa  298  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 896 aa  298  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 841 aa  298  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 855 aa  297  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 924 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 867 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 855 aa  296  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 924 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 966 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 924 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 849 aa  293  7e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 867 aa  293  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 867 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 867 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 855 aa  290  7e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 853 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 838 aa  287  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 925 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  29.12 
 
 		 853 aa  283  9e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 853 aa  280  8e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  27.66 
 
 		 966 aa  280  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 853 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 853 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 866 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 836 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 871 aa  275  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 874 aa  275  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  28.41 
 
 		 922 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 817 aa  268  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 935 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 901 aa  266  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  27.77 
 
 		 866 aa  261  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 907 aa  260  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 910 aa  258  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 937 aa  258  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 933 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 869 aa  252  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 927 aa  249  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 930 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 930 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  27.78 
 
 		 880 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 904 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 935 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 935 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 935 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 930 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 944 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 879 aa  244  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 948 aa  243  9e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 907 aa  243  9e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  26.22 
 
 		 877 aa  243  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 987 aa  243  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 873 aa  243  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 928 aa  241  5e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 873 aa  239  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  29.69 
 
 		 709 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  28 
 
 		 936 aa  239  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 884 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 975 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 894 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 974 aa  232  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>