More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0456 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
395 aa  810  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  32.27 
 
 
347 aa  125  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.32 
 
 
264 aa  122  1e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  29.58 
 
 
365 aa  115  1e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  38.67 
 
 
280 aa  112  1e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  30.04 
 
 
268 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.40796e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  30.59 
 
 
268 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.25 
 
 
278 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  32.33 
 
 
348 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  31.11 
 
 
518 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  31.28 
 
 
479 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  29.88 
 
 
336 aa  100  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  33.15 
 
 
502 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  29.46 
 
 
357 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  31.65 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  31.44 
 
 
500 aa  98.6  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  29.52 
 
 
483 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 
569 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  34.07 
 
 
561 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  27.6 
 
 
343 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  34.04 
 
 
392 aa  96.3  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
567 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  30.27 
 
 
354 aa  96.3  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  33.66 
 
 
481 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  38.32 
 
 
289 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  29.74 
 
 
358 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  30.43 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  30.08 
 
 
358 aa  94.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  32.07 
 
 
427 aa  93.2  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  27.31 
 
 
354 aa  92.8  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  27.18 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  30.5 
 
 
565 aa  92.8  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  29.73 
 
 
475 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  32.02 
 
 
483 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  27.92 
 
 
474 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  32.45 
 
 
484 aa  91.3  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  34.39 
 
 
343 aa  91.3  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  26.09 
 
 
632 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  26.09 
 
 
632 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  28.69 
 
 
480 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  31.31 
 
 
478 aa  90.1  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  33.16 
 
 
590 aa  90.1  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  31.69 
 
 
564 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  31.69 
 
 
588 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  31.69 
 
 
588 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  29.5 
 
 
562 aa  90.1  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  32.26 
 
 
533 aa  89.7  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  33.16 
 
 
569 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  25.12 
 
 
269 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  32.11 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  28.51 
 
 
479 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  31.35 
 
 
504 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  31.31 
 
 
478 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  37.13 
 
 
289 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  30.05 
 
 
589 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  31.52 
 
 
588 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  29.35 
 
 
481 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  31.75 
 
 
494 aa  88.2  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  37.13 
 
 
289 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  26.6 
 
 
573 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 
365 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  3.43868e-06  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  32.03 
 
 
363 aa  87.8  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  25.61 
 
 
288 aa  87.4  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  4.10475e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  29.51 
 
 
560 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  28.92 
 
 
604 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  29.51 
 
 
589 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  29.51 
 
 
572 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  29.51 
 
 
572 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  29.51 
 
 
572 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  29.51 
 
 
589 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  29.51 
 
 
572 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  28.32 
 
 
364 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  28.73 
 
 
561 aa  87  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  35.03 
 
 
352 aa  86.7  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  30.09 
 
 
486 aa  86.7  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  26.27 
 
 
349 aa  86.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  29.72 
 
 
424 aa  86.7  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  28.78 
 
 
521 aa  86.3  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  28.96 
 
 
564 aa  85.9  1e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  27.74 
 
 
432 aa  85.9  1e-15  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  28.96 
 
 
593 aa  85.5  1e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  27.32 
 
 
605 aa  85.9  1e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  28.98 
 
 
553 aa  85.5  1e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  29.78 
 
 
288 aa  85.1  2e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  27.38 
 
 
279 aa  84.7  2e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  33.15 
 
 
286 aa  84.7  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  28.76 
 
 
473 aa  85.1  2e-15  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  30.05 
 
 
564 aa  85.5  2e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  33.91 
 
 
550 aa  84.7  2e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  27.68 
 
 
478 aa  85.1  2e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  30.65 
 
 
562 aa  84.3  3e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  28.83 
 
 
554 aa  84.3  3e-15  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  27.68 
 
 
478 aa  84.3  3e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  27.68 
 
 
478 aa  84.7  3e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  29.61 
 
 
513 aa  84.3  3e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  27.68 
 
 
478 aa  84.7  3e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  28.52 
 
 
528 aa  84.7  3e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  29.61 
 
 
482 aa  84.3  4e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  31.32 
 
 
484 aa  84  4e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  30.93 
 
 
490 aa  84  4e-15  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>