More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0419 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  62.52 
 
 
505 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  62.92 
 
 
505 aa  675    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  100 
 
 
513 aa  1068    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  63.26 
 
 
508 aa  686    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  58.04 
 
 
545 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  56.2 
 
 
554 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  56.65 
 
 
526 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  56.67 
 
 
552 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  55.62 
 
 
515 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  55.44 
 
 
557 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  55.33 
 
 
502 aa  560  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  55.19 
 
 
496 aa  555  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  55.83 
 
 
496 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  53.85 
 
 
522 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  52.05 
 
 
525 aa  540  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  54.64 
 
 
579 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  52.54 
 
 
555 aa  533  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  52.24 
 
 
548 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  52.44 
 
 
547 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  53.27 
 
 
567 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  52.85 
 
 
512 aa  520  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  50.93 
 
 
549 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  50.58 
 
 
521 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  52.24 
 
 
560 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  51.93 
 
 
544 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  50 
 
 
533 aa  514  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  51.63 
 
 
514 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  51.63 
 
 
514 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  51.02 
 
 
505 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  48.73 
 
 
525 aa  494  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  47.46 
 
 
512 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  49.79 
 
 
522 aa  468  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  46.68 
 
 
508 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  47.42 
 
 
552 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  48.45 
 
 
522 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  43.96 
 
 
517 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  45.36 
 
 
510 aa  442  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  46.06 
 
 
512 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  45.58 
 
 
564 aa  422  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  42.67 
 
 
546 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  41.4 
 
 
542 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  34.23 
 
 
569 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  33.64 
 
 
555 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  33.99 
 
 
554 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  32.19 
 
 
590 aa  239  9e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  32.52 
 
 
556 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  33.14 
 
 
569 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  32.44 
 
 
561 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  32.06 
 
 
556 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  30.48 
 
 
524 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  31.88 
 
 
561 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  29.52 
 
 
440 aa  218  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  28.92 
 
 
470 aa  211  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  34.46 
 
 
462 aa  206  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  31.63 
 
 
486 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  29.71 
 
 
480 aa  200  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  30.22 
 
 
551 aa  196  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  30.22 
 
 
551 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  29.98 
 
 
496 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  30.02 
 
 
551 aa  194  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  30.02 
 
 
551 aa  194  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  30.02 
 
 
551 aa  194  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  29.91 
 
 
458 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  31.57 
 
 
466 aa  189  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  30.11 
 
 
497 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  28 
 
 
497 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  28 
 
 
497 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  28.2 
 
 
497 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  28.2 
 
 
497 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  27.08 
 
 
550 aa  167  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  29.83 
 
 
506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  27.89 
 
 
497 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  27.88 
 
 
522 aa  153  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  27.36 
 
 
440 aa  151  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  29.37 
 
 
482 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  28.92 
 
 
471 aa  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  29.16 
 
 
520 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  27.64 
 
 
501 aa  150  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  30.44 
 
 
472 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  27.36 
 
 
523 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  29.74 
 
 
457 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  30.34 
 
 
486 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  27.8 
 
 
491 aa  143  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  25.11 
 
 
452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  27.88 
 
 
497 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  28.8 
 
 
506 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  27.57 
 
 
491 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  28.17 
 
 
453 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  29.95 
 
 
638 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  28.15 
 
 
453 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  26.42 
 
 
440 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  30.27 
 
 
500 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  27.73 
 
 
487 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  28.88 
 
 
470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  31.51 
 
 
523 aa  136  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  28.36 
 
 
500 aa  136  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  27.29 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  29.08 
 
 
495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  27.54 
 
 
493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  31.14 
 
 
503 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>