120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0383 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  233  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  79.83 
 
 		 119 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  86.41 
 
 		 117 aa  176  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  83.96 
 
 		 114 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  69.81 
 
 		 116 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  69.81 
 
 		 116 aa  159  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  73.53 
 
 		 115 aa  158  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  69.81 
 
 		 116 aa  158  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  68.87 
 
 		 116 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  68.87 
 
 		 117 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  69.81 
 
 		 116 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  69.81 
 
 		 116 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  69.81 
 
 		 116 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  70.75 
 
 		 116 aa  150  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  53.91 
 
 		 134 aa  131  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  53.77 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  54.9 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  53.92 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  54.9 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  54.9 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  54.9 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  53.92 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  53.92 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  53.92 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  53.92 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  53.92 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  53.92 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  48.6 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  53.92 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1921  hypothetical protein  47.17 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  36.04 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  39.18 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  37.27 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  39.18 
 
 		 131 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  41.67 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  36.19 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  37.04 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  37.11 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  36.21 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  36.21 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  37.23 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  38.95 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  35 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  35.48 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  35.48 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  41.67 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0208  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.776323  normal  0.198508 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  35.48 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  35.48 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  35.48 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  34.41 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  35.48 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  32.67 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2903  hypothetical protein  29.41 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0923004  normal  0.0879248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2427  hypothetical protein  29.41 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  29.63 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  32.32 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  32.32 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2505  hypothetical protein  28.43 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00216917  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  34.48 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2278  hypothetical protein  28.43 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2261  hypothetical protein  28.43 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000353755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2487  hypothetical protein  28.43 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2219  hypothetical protein  28.43 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2566  hypothetical protein  28.43 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0631165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  29.11 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  34.88 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  29.41 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3346  hypothetical protein  41.18 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  32.43 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  28.92 
 
 		 130 aa  50.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  31.08 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  25.81 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  29.73 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  30.56 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  28.17 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  35.06 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  42.22 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  43.33 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  25.81 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  31.33 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  42.03 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  47.27 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  31.08 
 
 		 386 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  29.87 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  34.21 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  38.55 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  35.94 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  42.31 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  30.99 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  38.46 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  36.99 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  36.51 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  36.84 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  37.97 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  27.5 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  37.97 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>