More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0323 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  62.38 
 
 
739 aa  941  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  51.37 
 
 
735 aa  758  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  61.77 
 
 
737 aa  912  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  61.94 
 
 
736 aa  934  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  62.6 
 
 
738 aa  950  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  61.38 
 
 
738 aa  929  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  9.66561e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  61.19 
 
 
737 aa  927  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  62.47 
 
 
738 aa  947  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  61.25 
 
 
738 aa  929  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  3.04178e-12 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  69.08 
 
 
737 aa  1015  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  62.35 
 
 
738 aa  938  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  66.67 
 
 
738 aa  1008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  100 
 
 
735 aa  1492  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  7.55516e-06  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  61.52 
 
 
738 aa  931  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  63.27 
 
 
734 aa  935  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  50.55 
 
 
745 aa  707  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  62.19 
 
 
754 aa  897  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  74.8 
 
 
751 aa  1156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  6.72418e-09 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  37.45 
 
 
776 aa  459  1e-128  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  37.29 
 
 
771 aa  458  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  36.76 
 
 
764 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  34.29 
 
 
748 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  32.85 
 
 
741 aa  390  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  34.07 
 
 
777 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  34.99 
 
 
750 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  33.83 
 
 
728 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  34.86 
 
 
745 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  33.69 
 
 
727 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  2.93733e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  34.07 
 
 
728 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  32.84 
 
 
751 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  33.98 
 
 
728 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  32.71 
 
 
728 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  32.69 
 
 
728 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  31.65 
 
 
753 aa  358  2e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  32.28 
 
 
790 aa  352  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  31.16 
 
 
733 aa  343  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  32.02 
 
 
767 aa  325  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  30.31 
 
 
933 aa  311  3e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  30.31 
 
 
945 aa  311  3e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  30.31 
 
 
728 aa  311  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  30.85 
 
 
852 aa  301  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  30.42 
 
 
920 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  30.42 
 
 
930 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  29.74 
 
 
714 aa  300  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  30.05 
 
 
804 aa  294  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  29.15 
 
 
796 aa  294  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  29.4 
 
 
813 aa  291  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  29.13 
 
 
798 aa  291  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  3.95852e-07 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  29.46 
 
 
803 aa  290  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  2.95709e-05 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  29.46 
 
 
803 aa  290  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  29.32 
 
 
803 aa  290  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  32.87 
 
 
667 aa  283  8e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  29.01 
 
 
729 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  34.09 
 
 
760 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  28.95 
 
 
720 aa  225  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  3.42926e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  33.91 
 
 
740 aa  211  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  30.89 
 
 
740 aa  204  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  27.1 
 
 
733 aa  184  5e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  25.74 
 
 
746 aa  181  5e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  1.24103e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  40.59 
 
 
923 aa  178  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  32.83 
 
 
981 aa  177  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  38.75 
 
 
950 aa  175  3e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  37.94 
 
 
707 aa  165  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  33.07 
 
 
875 aa  162  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  36.68 
 
 
909 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  37.09 
 
 
900 aa  161  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  29.56 
 
 
775 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  32.63 
 
 
256 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  33.45 
 
 
260 aa  153  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  34.86 
 
 
311 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  35.93 
 
 
894 aa  152  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  32.39 
 
 
320 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  34.56 
 
 
293 aa  149  2e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  33.45 
 
 
253 aa  146  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.06968e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  32.62 
 
 
263 aa  144  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  3.90545e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  34.62 
 
 
273 aa  143  1e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  31.6 
 
 
272 aa  140  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.98 
 
 
263 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  30.38 
 
 
333 aa  138  3e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  31.83 
 
 
259 aa  139  3e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  32.28 
 
 
263 aa  137  7e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  32.28 
 
 
263 aa  137  7e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.44848e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  31.48 
 
 
320 aa  137  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  32.28 
 
 
263 aa  136  1e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  31.48 
 
 
320 aa  137  1e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  32.28 
 
 
263 aa  137  1e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  32.28 
 
 
263 aa  136  1e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  32.28 
 
 
263 aa  136  1e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  34.97 
 
 
262 aa  135  2e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  31.93 
 
 
263 aa  136  2e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  31.6 
 
 
250 aa  135  4e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  32.43 
 
 
330 aa  134  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  1.89708e-05 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  31.91 
 
 
263 aa  132  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  31.91 
 
 
263 aa  131  4e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.04019e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  32.55 
 
 
310 aa  131  4e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  31.72 
 
 
323 aa  130  8e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  32.07 
 
 
275 aa  130  9e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  32.07 
 
 
311 aa  129  2e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  33.33 
 
 
302 aa  129  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  35.35 
 
 
287 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>