84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0282 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  100 
 
 
154 aa  311  2e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.26692e-08  unclonable  2.42912e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  54.72 
 
 
168 aa  179  9e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  5.25037e-06  unclonable  8.29203e-11 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3932  protein of unknown function Spy-related  53.8 
 
 
160 aa  164  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.05476e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  50.67 
 
 
163 aa  145  1e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  2.05349e-05  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  49.33 
 
 
163 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  49.33 
 
 
163 aa  140  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  5.50011e-05  hitchhiker  1.61676e-09 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  50 
 
 
163 aa  139  1e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  5.28053e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  42.55 
 
 
147 aa  126  1e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  2.21664e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  46 
 
 
163 aa  125  2e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.63608e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  43.83 
 
 
174 aa  119  2e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  4.30973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  42.86 
 
 
174 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  40.62 
 
 
163 aa  111  4e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  1.29305e-05  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0257  protein of unknown function Spy-related  42.24 
 
 
174 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  6.63543e-06  decreased coverage  1.15808e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0262  hypothetical protein  42.24 
 
 
174 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.18811e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3460  spheroplast protein y precursor, putative  37.72 
 
 
181 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.6442e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  37.58 
 
 
157 aa  83.6  1e-15  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  36.99 
 
 
161 aa  82.4  2e-15  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  41.38 
 
 
161 aa  81.3  5e-15  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  41.38 
 
 
161 aa  81.3  5e-15  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  41.38 
 
 
161 aa  81.3  5e-15  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  39.02 
 
 
161 aa  79.7  1e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  40.52 
 
 
161 aa  80.1  1e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  40.52 
 
 
161 aa  79.7  1e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  39.02 
 
 
161 aa  79.7  1e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  40.52 
 
 
161 aa  79.7  1e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  41.38 
 
 
156 aa  80.1  1e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  40.52 
 
 
161 aa  80.1  1e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  39.02 
 
 
161 aa  79.7  1e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  34.93 
 
 
162 aa  79  2e-14  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  39.02 
 
 
161 aa  79  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  39.02 
 
 
161 aa  78.6  3e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  36 
 
 
169 aa  77.8  5e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  35.21 
 
 
170 aa  75.5  3e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  2.85493e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  33.77 
 
 
162 aa  74.7  4e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  3.37772e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  33.77 
 
 
162 aa  74.7  4e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  33.77 
 
 
162 aa  74.7  4e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  32.03 
 
 
158 aa  72.8  2e-12  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  31.13 
 
 
162 aa  70.9  5e-12  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1561  periplasmic repressor CpxP  35.95 
 
 
166 aa  68.6  3e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  2.04071e-08  unclonable  1.90173e-12 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  35.24 
 
 
162 aa  67.8  5e-11  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  31.51 
 
 
166 aa  65.5  3e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  31.51 
 
 
170 aa  65.1  3e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  31.51 
 
 
167 aa  65.5  3e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  31.51 
 
 
166 aa  65.5  3e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  31.51 
 
 
166 aa  65.5  3e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  31.51 
 
 
166 aa  65.5  3e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  31.51 
 
 
166 aa  65.5  3e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  34.48 
 
 
166 aa  63.9  8e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  30.82 
 
 
166 aa  62.8  2e-09  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  30.82 
 
 
166 aa  62.8  2e-09  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  30.82 
 
 
166 aa  61.2  4e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  30.82 
 
 
166 aa  61.6  4e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  30.82 
 
 
166 aa  61.2  4e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  30.82 
 
 
166 aa  61.2  4e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  30.82 
 
 
166 aa  61.2  4e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  6.13131e-08 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  29.5 
 
 
159 aa  58.9  2e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  29.27 
 
 
166 aa  58.5  3e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.56086e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  38.46 
 
 
168 aa  58.2  4e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  2.03252e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1376  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  31.37 
 
 
185 aa  53.1  1e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0129  putative stress resistance protein  29.41 
 
 
174 aa  51.2  5e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4809  periplasmic repressor of cpx regulon by interaction with CpxA, rescue from transitory stresses  31.68 
 
 
147 aa  50.4  8e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  28.87 
 
 
174 aa  50.4  8e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  30.3 
 
 
178 aa  50.1  1e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1222  protein of unknown function, Spy-related  28.76 
 
 
173 aa  49.7  1e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0499596  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1751  hypothetical protein  31.08 
 
 
152 aa  49.3  2e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  7.49705e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2300  protein of unknown function, Spy-related  29.17 
 
 
147 aa  49.3  2e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  3.65275e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2263  periplasmic repressor CpxP  30.72 
 
 
167 aa  48.9  2e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.48096e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2741  hypothetical protein  30.47 
 
 
156 aa  47.8  5e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0263375 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0717  hypothetical protein  31.39 
 
 
170 aa  47.4  7e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0320  hypothetical protein  29.03 
 
 
185 aa  47  9e-05  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  4.49922e-06  hitchhiker  1.08776e-08 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4032  putative stress resistance protein  25 
 
 
190 aa  47  9e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1680  hypothetical protein  28.77 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3847  hypothetical protein  28.57 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2530  hypothetical protein  31 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00527013 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1674  hypothetical protein  28.97 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3849  putative stress resistance protein  26.26 
 
 
174 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227147  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0892  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  28.89 
 
 
210 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1143  hypothetical protein  29.56 
 
 
178 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4322  lipoprotein signal peptide  28.7 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00684015 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00939  hypothetical protein  29.37 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00188533  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4212  putative lipoprotein signal peptide  28.7 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  29.22 
 
 
162 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00534  hypothetical protein  26.36 
 
 
275 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  28.12 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  3.64222e-12  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>