72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0276 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  100 
 
 
117 aa  243  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  1.56346e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  94.02 
 
 
117 aa  230  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  77.78 
 
 
117 aa  202  9e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  76.92 
 
 
117 aa  200  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  77.31 
 
 
119 aa  196  1e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  72.65 
 
 
117 aa  191  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  80.34 
 
 
117 aa  182  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  75 
 
 
117 aa  174  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  77 
 
 
101 aa  173  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  50.86 
 
 
116 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  50.86 
 
 
120 aa  133  7e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  40.8 
 
 
127 aa  87  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  38.4 
 
 
127 aa  81.6  3e-15  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  41.12 
 
 
126 aa  81.3  4e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  37.6 
 
 
126 aa  81.3  4e-15  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  35.2 
 
 
135 aa  80.5  7e-15  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  44.86 
 
 
126 aa  78.2  3e-14  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  37.93 
 
 
122 aa  72.4  2e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  33.33 
 
 
122 aa  68.9  2e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  37.5 
 
 
116 aa  68.9  2e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  35.85 
 
 
122 aa  67.8  4e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  32.14 
 
 
122 aa  67  9e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  35.66 
 
 
126 aa  66.6  1e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  30.48 
 
 
122 aa  62.4  2e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  34.26 
 
 
596 aa  62  3e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.70258e-06  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  30.1 
 
 
123 aa  60.5  7e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  35.09 
 
 
113 aa  60.5  8e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  31.31 
 
 
122 aa  60.5  9e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  35.71 
 
 
116 aa  58.9  2e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  29.57 
 
 
118 aa  58.9  2e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  39.51 
 
 
137 aa  59.3  2e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  30.1 
 
 
123 aa  59.3  2e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  39.76 
 
 
172 aa  58.9  2e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  34.21 
 
 
114 aa  58.9  2e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  34.26 
 
 
596 aa  58.5  3e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  32.23 
 
 
596 aa  58.2  4e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  32.23 
 
 
596 aa  58.2  4e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.88 
 
 
596 aa  57.8  5e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  33.88 
 
 
597 aa  57.4  6e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  33.88 
 
 
596 aa  57.4  6e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  38.75 
 
 
137 aa  56.6  1e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  33.88 
 
 
596 aa  55.5  2e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  33.88 
 
 
596 aa  55.5  2e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  33.88 
 
 
596 aa  55.5  2e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  33.88 
 
 
596 aa  55.5  2e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  31.67 
 
 
118 aa  53.9  6e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  35.96 
 
 
155 aa  53.9  7e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  34.65 
 
 
144 aa  53.9  7e-07  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  32.41 
 
 
596 aa  53.5  1e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  30.84 
 
 
583 aa  52  3e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.06 
 
 
122 aa  50.8  6e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  30.85 
 
 
118 aa  50.4  7e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.41 
 
 
593 aa  50.4  7e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  29.27 
 
 
596 aa  50.4  8e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  32.48 
 
 
588 aa  49.7  1e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  31.68 
 
 
146 aa  48.9  2e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  34.23 
 
 
591 aa  47  8e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  36.71 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  34 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0627  hypothetical protein  30.17 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.593343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  32.05 
 
 
596 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2727  cytochrome c3  30.97 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  29.73 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.87 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2388  cytochrome c3  30.17 
 
 
116 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.213014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2511  cytochrome c3  30.17 
 
 
116 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000190498  hitchhiker  4.40978e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2318  cytochrome c3  30.17 
 
 
116 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1786  cytochrome c3  30.17 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.790762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2492  cytochrome c3  30.17 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129247  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1793  cytochrome c3  30.17 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1830  cytochrome c3  30.17 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.428734  normal  0.412848 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2892  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>