More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0275 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  83.53 
 
 
506 aa  905  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  85.57 
 
 
506 aa  896  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  94.86 
 
 
506 aa  986  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  100 
 
 
506 aa  1055  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  3.26146e-08 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  83 
 
 
506 aa  901  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  82.56 
 
 
367 aa  658  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  83.6 
 
 
506 aa  898  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  80 
 
 
506 aa  837  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  83.2 
 
 
506 aa  896  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  56.02 
 
 
500 aa  572  1e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  56.81 
 
 
494 aa  539  1e-152  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  48.13 
 
 
519 aa  471  1e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  47.79 
 
 
517 aa  460  1e-128  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  46.37 
 
 
519 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  46.27 
 
 
519 aa  453  1e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  47.19 
 
 
517 aa  454  1e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  46.79 
 
 
517 aa  445  1e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  46.25 
 
 
512 aa  419  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  43.91 
 
 
521 aa  399  1e-110  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  41.6 
 
 
507 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  41.88 
 
 
506 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  41.88 
 
 
506 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  40.88 
 
 
505 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  39.88 
 
 
503 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  39.72 
 
 
506 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  43.2 
 
 
511 aa  377  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  40.62 
 
 
510 aa  362  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  40.99 
 
 
517 aa  350  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  40.04 
 
 
517 aa  343  5e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  39.68 
 
 
500 aa  341  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  39.92 
 
 
499 aa  340  5e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  41.38 
 
 
520 aa  338  9e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  39.77 
 
 
519 aa  332  7e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  39.19 
 
 
511 aa  330  5e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  39.21 
 
 
515 aa  322  1e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  37.64 
 
 
521 aa  320  5e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  36.72 
 
 
518 aa  315  1e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  4.01985e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  37.12 
 
 
507 aa  306  8e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  36.36 
 
 
508 aa  300  5e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  6.66036e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  37.18 
 
 
483 aa  299  7e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  36.49 
 
 
501 aa  276  5e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  32.24 
 
 
505 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  34.18 
 
 
491 aa  243  8e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0251  flavocytochrome c  81.48 
 
 
161 aa  234  2e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  33.55 
 
 
599 aa  228  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  34.3 
 
 
515 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  34.11 
 
 
515 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  34.27 
 
 
609 aa  221  2e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  33.4 
 
 
515 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  32.19 
 
 
584 aa  210  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  31.22 
 
 
605 aa  203  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  32.48 
 
 
598 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.51715e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  31.58 
 
 
586 aa  192  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  30.75 
 
 
606 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  30.75 
 
 
582 aa  190  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  35.17 
 
 
596 aa  190  6e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  32.96 
 
 
596 aa  190  6e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  35.17 
 
 
596 aa  190  6e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  35.17 
 
 
596 aa  190  6e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  35.17 
 
 
596 aa  190  6e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.39 
 
 
596 aa  189  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  32.35 
 
 
597 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  34.53 
 
 
596 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  34.53 
 
 
596 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  30.75 
 
 
582 aa  186  1e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  29.8 
 
 
603 aa  184  2e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  30.36 
 
 
586 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  32.35 
 
 
591 aa  180  5e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  3.82997e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  30.75 
 
 
582 aa  174  2e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  30.75 
 
 
582 aa  174  2e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  29.85 
 
 
588 aa  174  4e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  30.96 
 
 
582 aa  173  7e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.18 
 
 
502 aa  170  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  27.84 
 
 
447 aa  167  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  29.35 
 
 
596 aa  167  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  29.71 
 
 
650 aa  167  5e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  29.54 
 
 
464 aa  166  8e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.93943e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.64 
 
 
457 aa  163  5e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  9.88882e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  31.49 
 
 
596 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  32.16 
 
 
596 aa  161  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.70258e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.47 
 
 
593 aa  160  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  31.02 
 
 
597 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  31.94 
 
 
596 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  28.8 
 
 
598 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  28.88 
 
 
598 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  30.46 
 
 
596 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  29.1 
 
 
608 aa  154  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  2.54788e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  31.13 
 
 
583 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.28 
 
 
465 aa  150  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  31.83 
 
 
925 aa  149  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  31.99 
 
 
591 aa  149  1e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  30.59 
 
 
957 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  31.4 
 
 
589 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.44139e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  28.45 
 
 
589 aa  147  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  28.8 
 
 
631 aa  145  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.91 
 
 
589 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.59 
 
 
493 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  31.13 
 
 
925 aa  138  3e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  28.54 
 
 
561 aa  135  1e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  26.54 
 
 
635 aa  136  1e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>