More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0225 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  100 
 
 		 199 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  54.08 
 
 		 195 aa  245  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  55.08 
 
 		 200 aa  232  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  51.02 
 
 		 198 aa  226  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  55.74 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  55.19 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  55.19 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  51.02 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  54.64 
 
 		 196 aa  219  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  52.17 
 
 		 199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  49.75 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  49.75 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  49.75 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  49.75 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  52.17 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  53.06 
 
 		 196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  49.24 
 
 		 198 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  51.31 
 
 		 200 aa  211  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  50.26 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  49.72 
 
 		 203 aa  208  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  50.26 
 
 		 196 aa  208  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  50.26 
 
 		 196 aa  208  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  50.26 
 
 		 196 aa  207  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  49.74 
 
 		 196 aa  207  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  51.65 
 
 		 204 aa  207  8e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  47.24 
 
 		 199 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  46.73 
 
 		 199 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  47.94 
 
 		 205 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  49.74 
 
 		 196 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  49.74 
 
 		 196 aa  205  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  49.74 
 
 		 196 aa  205  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  45.23 
 
 		 199 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  47.69 
 
 		 222 aa  201  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  51.89 
 
 		 205 aa  194  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  47.59 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  47.37 
 
 		 171 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  45.66 
 
 		 175 aa  168  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  45.66 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  38.75 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  38.65 
 
 		 173 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  39.44 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  37.72 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  36.99 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  40.25 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  40.26 
 
 		 168 aa  124  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  35.84 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  37.06 
 
 		 173 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4038  carbonic anhydrase  39.26 
 
 		 180 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820028  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  39.39 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  37.65 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  40.82 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  35.84 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  40.45 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  36.84 
 
 		 171 aa  122  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  37.79 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  38.96 
 
 		 185 aa  121  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  39.77 
 
 		 173 aa  121  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  33.72 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  39.51 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  36.21 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  36.46 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  35.26 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.26 
 
 		 166 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  38.18 
 
 		 172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2341  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.03 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  35.84 
 
 		 174 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  34.73 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2083  putative acetyltransferase  39.66 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  36 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  36.47 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4655  transferase family protein  37.11 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4511  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  37.11 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4879  transferase family protein  37.11 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0900  carbonic anhydrase  38.1 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5010  transferase family protein  37.11 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3022  hexapaptide repeat-containing transferase  43.26 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  35.26 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0660  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.59 
 
 		 182 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3098  ferripyochelin binding protein  43.26 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  34.68 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2773  hypothetical protein  35.22 
 
 		 172 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000332346  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  33.13 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  37.27 
 
 		 174 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4905  transferase family protein  35.85 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0370  transferase family protein  35.22 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  39.49 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3431  putative acetyltransferase/acyltransferase  35.85 
 
 		 170 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1631  carbonic anhydrase  38.1 
 
 		 160 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.947333  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0768  ferripyochelin binding protein (fbp)  33.55 
 
 		 178 aa  115  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0612  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.11 
 
 		 177 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.209956  normal  0.317637 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1692  hexapaptide repeat-containing transferase  41.22 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4493  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  35.22 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4870  transferase family protein  35.22 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4896  transferase family protein  35.22 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4587  acetyltransferase/acyltransferase  35.22 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  34.68 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  38.12 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.14 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  32.95 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.78593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>