More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0152 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  100 
 
 		 296 aa  614  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  36.2 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 365 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  24.56 
 
 		 363 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 286 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  26.44 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  25.63 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.34 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  27.75 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4441  methyltransferase type 11  25.73 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  24.45 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  33.05 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.6 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  29.63 
 
 		 207 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  33 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  26.09 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  27.18 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  24.78 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  26.82 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  26.09 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  26.15 
 
 		 353 aa  68.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.94 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  22.91 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.27 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  36 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  31 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.32 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.07 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  31.58 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4369  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  24.77 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4431  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.184386 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  31.62 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.62 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.62 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  26.11 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.29 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  34.73 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.25 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0806  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.56 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.622934  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0043  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.57 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1304  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.71 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308237  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.14 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.13 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  27.63 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.27 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  23.27 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4986  predicted protein  26.34 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.778509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.38 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.65 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  28.39 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  30.63 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0369  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.39 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0467778  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.25 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  38.18 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1269  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  23.48 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.54 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2231  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0346  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.39 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.423606  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1638  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.52 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.96 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  27.63 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  25.51 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  24.78 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  33.33 
 
 		 248 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.84 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 243 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.35 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  36.19 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.66 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.228971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0598  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  26.56 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  23.44 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.57 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46747  predicted protein  40.54 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>