39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0138 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  690    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  81.25 
 
 		 336 aa  577  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  71.73 
 
 		 336 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  64.41 
 
 		 340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  52.89 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  50.87 
 
 		 345 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  50.58 
 
 		 345 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  52.21 
 
 		 338 aa  351  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  49.71 
 
 		 345 aa  348  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  51.74 
 
 		 342 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  51.45 
 
 		 342 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  51.16 
 
 		 342 aa  338  7e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  32.6 
 
 		 337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  31.17 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  29.48 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  28.74 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  29.04 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  28.96 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  28.74 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  28.14 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  28.14 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  30.22 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  28.99 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  29.88 
 
 		 360 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  28.62 
 
 		 364 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  29.48 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  28.48 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  26.07 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  28.22 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  25.53 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  25.52 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  25.5 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  30.16 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  24.77 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  24.62 
 
 		 523 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  22.6 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  24.12 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25160  hypothetical protein  21.92 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0874  hypothetical protein  26.74 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.256496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>