69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0134 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  82.28 
 
 		 535 aa  833    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  75.52 
 
 		 534 aa  754    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  68.93 
 
 		 534 aa  683    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  83.98 
 
 		 511 aa  813    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  75.56 
 
 		 528 aa  769    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  88.1 
 
 		 537 aa  927    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  82.04 
 
 		 535 aa  875    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  80.44 
 
 		 540 aa  828    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  82.46 
 
 		 535 aa  836    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  76.91 
 
 		 522 aa  743    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  80.44 
 
 		 540 aa  829    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  90.89 
 
 		 538 aa  941    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  82.28 
 
 		 535 aa  838    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  88.31 
 
 		 539 aa  911    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  73.43 
 
 		 532 aa  754    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  84.97 
 
 		 539 aa  878    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  80.63 
 
 		 540 aa  830    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  100 
 
 		 538 aa  1070    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  75.14 
 
 		 530 aa  761    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  75.57 
 
 		 525 aa  762    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  53.22 
 
 		 512 aa  509  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  47.68 
 
 		 518 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  48.18 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  43.57 
 
 		 519 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  43.7 
 
 		 515 aa  425  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  43.37 
 
 		 519 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  42.99 
 
 		 519 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  42.03 
 
 		 511 aa  412  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  44.55 
 
 		 519 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  43.37 
 
 		 519 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  42.77 
 
 		 518 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  42.31 
 
 		 520 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  42.97 
 
 		 519 aa  388  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  40.95 
 
 		 512 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  41.98 
 
 		 529 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  42.88 
 
 		 519 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  41.65 
 
 		 519 aa  372  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  42.34 
 
 		 519 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  42.34 
 
 		 519 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  42.34 
 
 		 519 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  38.57 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.69 
 
 		 508 aa  360  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  37.12 
 
 		 512 aa  357  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  37.12 
 
 		 512 aa  357  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  39.06 
 
 		 505 aa  352  7e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  37.52 
 
 		 507 aa  352  8e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.6 
 
 		 510 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.6 
 
 		 508 aa  345  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.6 
 
 		 510 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.6 
 
 		 508 aa  345  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  38.4 
 
 		 508 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.4 
 
 		 508 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  38.4 
 
 		 508 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  38.4 
 
 		 508 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  38.74 
 
 		 506 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  33.97 
 
 		 520 aa  333  4e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  38.27 
 
 		 585 aa  327  5e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  38.65 
 
 		 523 aa  324  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  36.77 
 
 		 518 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  36.58 
 
 		 518 aa  296  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  34.67 
 
 		 552 aa  291  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  34.83 
 
 		 509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  40.07 
 
 		 305 aa  213  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  35.5 
 
 		 263 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3467  hypothetical protein  43.06 
 
 		 240 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0456304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  33.02 
 
 		 484 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0766  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  33.98 
 
 		 477 aa  45.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.607983  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  43.14 
 
 		 500 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2668  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  38.46 
 
 		 460 aa  43.5  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>