45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0092 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0092  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  71.95 
 
 		 261 aa  346  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  54.25 
 
 		 245 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  53.77 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  53.77 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  53.3 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  54.68 
 
 		 244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  51.4 
 
 		 241 aa  241  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  51.87 
 
 		 241 aa  241  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  51.4 
 
 		 241 aa  240  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  51.9 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  49.06 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0129  hypothetical protein  49.77 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00774335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  26.15 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  27.1 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  27.01 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  24.3 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  24.54 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  24.54 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  24.77 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  24.54 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0639  hypothetical protein  23.53 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72220  hypothetical protein  27.23 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  27.57 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.12 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  22.06 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.26 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.57 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  21.12 
 
 		 269 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1176  extracellular solute-binding protein family 3  23.74 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 268 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3995  extracellular solute-binding protein family 3  27.18 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0932187  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 322 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4186  extracellular solute-binding protein family 3  27.62 
 
 		 263 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  23.61 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  27.21 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1256  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.3 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0217  extracellular solute-binding protein family 3  27.18 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  17.78 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  22.97 
 
 		 293 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>