46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0077 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  80.6 
 
 		 497 aa  850    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  1043    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  75.31 
 
 		 499 aa  795    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  67.47 
 
 		 499 aa  743    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  65.17 
 
 		 494 aa  687    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  70.68 
 
 		 501 aa  758    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  63.94 
 
 		 494 aa  676    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  58.38 
 
 		 491 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  56.32 
 
 		 494 aa  595  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  57.52 
 
 		 491 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  57.28 
 
 		 490 aa  594  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  57.52 
 
 		 491 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  57.09 
 
 		 490 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  56.69 
 
 		 490 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  57.31 
 
 		 491 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  57.52 
 
 		 491 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  41.67 
 
 		 488 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  41.85 
 
 		 488 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  41.65 
 
 		 488 aa  375  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  40.83 
 
 		 487 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  31.22 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  30.8 
 
 		 493 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  27.29 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  27.63 
 
 		 483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  27.47 
 
 		 504 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  26.93 
 
 		 492 aa  140  7e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  25.48 
 
 		 497 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0276  hypothetical protein  28.26 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  26.89 
 
 		 410 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0793  hypothetical protein  28.52 
 
 		 444 aa  97.1  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0762  hypothetical protein  28.51 
 
 		 391 aa  95.1  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000000752788  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  28.19 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  26.17 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  29.77 
 
 		 542 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  23.85 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  24.62 
 
 		 543 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  25.51 
 
 		 580 aa  60.1  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  26.92 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  27.8 
 
 		 543 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  25.67 
 
 		 560 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  24.08 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  26.75 
 
 		 581 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  28.67 
 
 		 592 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  27.88 
 
 		 582 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3738  hypothetical protein  22.14 
 
 		 512 aa  50.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.99619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  24.89 
 
 		 549 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>