More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0074 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 252 aa  520  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  80.48 
 
 		 251 aa  421  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0664  putative glycosyltransferase  44.9 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0205038  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2126  glycosyl transferase family 2  40.49 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.4 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1250  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188831  normal  0.805856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  34.52 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  34.58 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  35.2 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  34.17 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 		 257 aa  131  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  32.93 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  30.74 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4045  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 285 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.242236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 		 265 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0862  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  32.26 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0981  beta 1,4 glucosyltransferase  28.96 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 249 aa  118  7e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  29.44 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  30.04 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  32.11 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  30.96 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3266  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2521  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  31.8 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0586  hypothetical protein  30.31 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 		 272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.28 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  35.46 
 
 		 267 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  31.69 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 521 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.69 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  31.2 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0390  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0975071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4586  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 		 272 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0951423  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  29.72 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.82 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  28.4 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  28.4 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  32 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.4 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  28.4 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  28.4 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  28.4 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1404  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189362  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.84 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 535 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  27.89 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.89 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  28.23 
 
 		 515 aa  103  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33.59 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3181  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187841 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  27.98 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1799  hypothetical protein  30.8 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561578 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  29.67 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0563  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>