More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0066 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
215 aa  447  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  1.33916e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  78.87 
 
 
218 aa  358  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  75.24 
 
 
215 aa  332  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  75.24 
 
 
215 aa  332  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  74.76 
 
 
215 aa  331  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  74.76 
 
 
215 aa  330  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  70.95 
 
 
225 aa  318  4e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  71.9 
 
 
215 aa  318  4e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  71.56 
 
 
215 aa  317  7e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  68.37 
 
 
217 aa  317  8e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  71.9 
 
 
215 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  71.9 
 
 
215 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  71.9 
 
 
215 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  9.36887e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  68.25 
 
 
220 aa  311  6e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  68.42 
 
 
213 aa  301  6e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  67.62 
 
 
215 aa  293  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  65.22 
 
 
211 aa  282  2e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  43.6 
 
 
242 aa  201  1e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
211 aa  195  5e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  43.13 
 
 
214 aa  191  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  44.27 
 
 
211 aa  191  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
218 aa  179  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
227 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  35.03 
 
 
215 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
215 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
245 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
221 aa  140  1e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
221 aa  139  4e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 
221 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
221 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
223 aa  133  2e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  35.18 
 
 
220 aa  133  2e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  34.67 
 
 
220 aa  133  2e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
238 aa  127  2e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 
241 aa  125  4e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
241 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
235 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
239 aa  117  1e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
239 aa  117  1e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
239 aa  117  1e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
239 aa  117  1e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
239 aa  117  1e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
239 aa  117  1e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
236 aa  116  2e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
252 aa  115  4e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
252 aa  115  4e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
252 aa  115  4e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
251 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
251 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
208 aa  114  8e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 
244 aa  114  1e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 
239 aa  114  1e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  32.67 
 
 
231 aa  113  2e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 
252 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 
236 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 
253 aa  111  7e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 
239 aa  111  7e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
220 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 
237 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
223 aa  104  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
222 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
191 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
205 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
209 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
219 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 
205 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
247 aa  95.5  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
204 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  29.45 
 
 
204 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
204 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 
223 aa  86.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  24.77 
 
 
220 aa  85.5  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
227 aa  84.7  1e-15  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
217 aa  84.3  1e-15  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 
211 aa  83.6  2e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
213 aa  81.3  1e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
220 aa  73.2  3e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  25.29 
 
 
221 aa  68.6  8e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  23.53 
 
 
182 aa  58.5  7e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 
185 aa  58.2  9e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
291 aa  58.2  9e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 
206 aa  56.2  4e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 
203 aa  55.5  6e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 
278 aa  55.5  7e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 
278 aa  55.5  7e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 
278 aa  55.5  7e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  32.1 
 
 
207 aa  55.1  8e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
213 aa  54.7  1e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 
199 aa  54.3  1e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
200 aa  54.7  1e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00630944 
 
 
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NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 
195 aa  54.3  1e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  21.12 
 
 
220 aa  53.5  2e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
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NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 
200 aa  53.9  2e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
205 aa  53.9  2e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 
174 aa  53.5  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.687421 
 
 
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NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
231 aa  53.5  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal 
 
 
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