194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0052 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  55.38 
 
 		 595 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  72.79 
 
 		 601 aa  931    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  66.39 
 
 		 599 aa  825    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  100 
 
 		 591 aa  1223    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  74.38 
 
 		 603 aa  948    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  72.62 
 
 		 601 aa  929    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  72.62 
 
 		 601 aa  928    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  72.64 
 
 		 602 aa  917    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  72.62 
 
 		 601 aa  929    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  73.4 
 
 		 619 aa  894    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  56.73 
 
 		 583 aa  655    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  74.42 
 
 		 603 aa  947    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  74.7 
 
 		 594 aa  924    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  74.38 
 
 		 603 aa  947    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  74.33 
 
 		 603 aa  943    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  73.88 
 
 		 603 aa  941    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  82.02 
 
 		 599 aa  1028    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  76.69 
 
 		 599 aa  952    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  52.32 
 
 		 589 aa  630  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  50 
 
 		 588 aa  574  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  49.02 
 
 		 587 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  46.59 
 
 		 590 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  46.77 
 
 		 598 aa  482  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  47.34 
 
 		 621 aa  485  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  43.03 
 
 		 613 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  44.4 
 
 		 593 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  41.81 
 
 		 1283 aa  468  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  43.24 
 
 		 586 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  42 
 
 		 584 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  36.14 
 
 		 619 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  38.81 
 
 		 621 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  34.09 
 
 		 610 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  34.9 
 
 		 629 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  35.61 
 
 		 611 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  33.61 
 
 		 609 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  35.21 
 
 		 611 aa  365  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  33.96 
 
 		 609 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  34.86 
 
 		 611 aa  364  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  33.79 
 
 		 609 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  34.47 
 
 		 609 aa  364  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  34.98 
 
 		 585 aa  363  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  38.11 
 
 		 609 aa  363  4e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  36.65 
 
 		 607 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  33.79 
 
 		 609 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  37.03 
 
 		 609 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  34.47 
 
 		 609 aa  362  9e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  35.74 
 
 		 609 aa  360  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  32.9 
 
 		 609 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  32.31 
 
 		 616 aa  355  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  35.28 
 
 		 592 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  35.2 
 
 		 616 aa  352  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  34.98 
 
 		 614 aa  349  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  37.69 
 
 		 605 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  36.92 
 
 		 615 aa  342  9e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  34.51 
 
 		 610 aa  342  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  36.8 
 
 		 615 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  36.87 
 
 		 615 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  33.78 
 
 		 616 aa  339  9e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  33.39 
 
 		 616 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  33.93 
 
 		 617 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  33.78 
 
 		 616 aa  336  7e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  34.4 
 
 		 618 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  36.03 
 
 		 615 aa  336  9e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  33.57 
 
 		 635 aa  335  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  33.57 
 
 		 637 aa  334  2e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  35.5 
 
 		 616 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  34.25 
 
 		 628 aa  333  5e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  31.86 
 
 		 617 aa  330  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  32.76 
 
 		 589 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  32.95 
 
 		 613 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  35.06 
 
 		 627 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  34.45 
 
 		 610 aa  324  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  32.27 
 
 		 628 aa  324  4e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  32.07 
 
 		 602 aa  323  4e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  35.81 
 
 		 566 aa  323  6e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  35.98 
 
 		 625 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  36.41 
 
 		 608 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  33.33 
 
 		 593 aa  320  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  39.69 
 
 		 593 aa  319  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  36.61 
 
 		 618 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  36.06 
 
 		 608 aa  317  4e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  33.56 
 
 		 625 aa  315  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  32.8 
 
 		 621 aa  311  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  34.3 
 
 		 624 aa  310  4e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  32.86 
 
 		 605 aa  309  9e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  36.67 
 
 		 629 aa  309  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  34.79 
 
 		 613 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  32.85 
 
 		 635 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  32.48 
 
 		 635 aa  301  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  32.85 
 
 		 635 aa  300  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  34.62 
 
 		 607 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  34.39 
 
 		 551 aa  295  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  34.62 
 
 		 607 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  34.62 
 
 		 607 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  30.7 
 
 		 646 aa  294  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  34.18 
 
 		 614 aa  287  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  34.11 
 
 		 614 aa  286  9e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  34.05 
 
 		 614 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  33.87 
 
 		 614 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  34.23 
 
 		 608 aa  283  7.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>