15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0028 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0028  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  470  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0206923 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0046  hypothetical protein  38.63 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2992  hypothetical protein  37.95 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289546  hitchhiker  0.00544099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2540  BioH protein, putative  33.63 
 
 		 240 aa  121  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1150  BioH protein, putative  33.18 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256241 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3005  BioH protein, putative  30.99 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773355 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0331  BioH protein, putative  29.38 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0342  BioH protein, putative  29.38 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0320  BioH protein, putative  28.44 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  32.67 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  31.68 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2080  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2124  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  30.69 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  28 
 
 		 568 aa  42.4  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>