More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2567 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  100 
 
 		 280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  45.88 
 
 		 286 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  47.48 
 
 		 294 aa  242  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  41.16 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  40.27 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  43.73 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  42.46 
 
 		 292 aa  218  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  43.53 
 
 		 282 aa  218  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  41.32 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  43.82 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  43.01 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  41.73 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  41.79 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  41.89 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  41.43 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  39.79 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  42.45 
 
 		 279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  40.78 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  40.78 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  39.53 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  40.28 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  41.43 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  41.43 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  41.43 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  39.65 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  41.09 
 
 		 272 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  39.1 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  41.43 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  40.85 
 
 		 289 aa  208  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  41.75 
 
 		 299 aa  208  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  41.43 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  41.43 
 
 		 283 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  44.72 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  41.26 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  41.01 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  41.99 
 
 		 274 aa  206  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  38.33 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  40.2 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  40.66 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 296 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  43.02 
 
 		 269 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  40.48 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  41.43 
 
 		 283 aa  202  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  38.18 
 
 		 283 aa  201  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 293 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  41.13 
 
 		 288 aa  201  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  38.69 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  39.81 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  42.12 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  41.44 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  44.03 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  39.65 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  48.33 
 
 		 287 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  40.36 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  38.08 
 
 		 283 aa  198  7e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  44.03 
 
 		 256 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  43.94 
 
 		 335 aa  198  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  39.31 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  44.32 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  39.66 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  40.07 
 
 		 280 aa  195  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  41.03 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  40.75 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  42.71 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  38.28 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  40.56 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  38.89 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  40.34 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 312 aa  192  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  41.7 
 
 		 272 aa  191  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  38.73 
 
 		 282 aa  191  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  40.34 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  37.33 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  40.85 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  37.09 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  40.34 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  38.13 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  38.3 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  40.85 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  39.93 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  40.85 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  38.31 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  39.44 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  39.64 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  39.08 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  40.85 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  38.57 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  39.86 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  41.24 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  36.43 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  41.55 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  38.23 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  41.55 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  41.55 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  41.55 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  41.54 
 
 		 529 aa  189  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  41.55 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  38.3 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  37.33 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  41.55 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>