More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2555 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 293 aa  567  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  69.31 
 
 		 293 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  62.33 
 
 		 292 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  61.81 
 
 		 294 aa  342  2.9999999999999997e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  61.09 
 
 		 292 aa  342  4e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  63.39 
 
 		 294 aa  341  9e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  61.74 
 
 		 302 aa  336  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  59.17 
 
 		 289 aa  328  6e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  54.3 
 
 		 291 aa  311  6.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  59.86 
 
 		 293 aa  310  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.06 
 
 		 291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  54.42 
 
 		 300 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  56.01 
 
 		 290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  53.58 
 
 		 293 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  53.9 
 
 		 294 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  55.17 
 
 		 291 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  54.83 
 
 		 291 aa  288  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  54.19 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  50 
 
 		 297 aa  278  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  51.69 
 
 		 298 aa  277  2e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  52.7 
 
 		 293 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  48.68 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  53.24 
 
 		 291 aa  271  9e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4260  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  55.27 
 
 		 310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4415  inner-membrane translocator  54.95 
 
 		 310 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4394  inner-membrane translocator  54.95 
 
 		 310 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  49.34 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  47.95 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  50.69 
 
 		 290 aa  261  6.999999999999999e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  48.84 
 
 		 301 aa  261  8e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.85 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  49.16 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  48.68 
 
 		 308 aa  256  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  48.68 
 
 		 308 aa  256  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  46.86 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  46.77 
 
 		 308 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  47.19 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0612  inner-membrane translocator  48.14 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  46.69 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.69 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  46.84 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  46.53 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.69 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  46.86 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  49.12 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  46.36 
 
 		 308 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3104  inner-membrane translocator  46.25 
 
 		 310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  47.47 
 
 		 302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  46.18 
 
 		 301 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  46.53 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  46.36 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1751  inner-membrane translocator  47.06 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48853  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  46.36 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  45.25 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  46.36 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  46.23 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  46.36 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  47.77 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  46.2 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  46.69 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  46.36 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  46.36 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  49.5 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  45.57 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  45.57 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  49.01 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  45.57 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  46.18 
 
 		 304 aa  249  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  45.03 
 
 		 300 aa  248  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  45.72 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  46.46 
 
 		 302 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  46.33 
 
 		 300 aa  244  9e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  45 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  45.39 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  44.67 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  45 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  47.18 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  44.59 
 
 		 305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  45.1 
 
 		 309 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  45.1 
 
 		 309 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.32 
 
 		 298 aa  242  6e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.32 
 
 		 298 aa  242  6e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2611  inner-membrane translocator  46.05 
 
 		 304 aa  242  7e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.404951  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  43.93 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  47.02 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  46.3 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.61 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  44.44 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.59 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1609  inner-membrane translocator  49.5 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  46.82 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  47.74 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.91 
 
 		 316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.91 
 
 		 316 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  44.44 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.7 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  44.22 
 
 		 304 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  44.87 
 
 		 316 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  44.12 
 
 		 338 aa  238  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.59 
 
 		 316 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>