More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2552 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 234 aa  465  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  73.5 
 
 		 235 aa  347  7e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  72.22 
 
 		 234 aa  343  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  69.53 
 
 		 235 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  69.66 
 
 		 235 aa  335  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  65.11 
 
 		 237 aa  323  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  64.53 
 
 		 234 aa  319  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  67.09 
 
 		 239 aa  318  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  66.09 
 
 		 235 aa  318  6e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  65.81 
 
 		 233 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  65.24 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  66.09 
 
 		 237 aa  310  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.81 
 
 		 234 aa  308  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  64.81 
 
 		 237 aa  308  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  64.81 
 
 		 233 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  62.23 
 
 		 236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.68 
 
 		 236 aa  305  3e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  63.68 
 
 		 238 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  64.38 
 
 		 239 aa  305  6e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  64.38 
 
 		 239 aa  304  9.000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  63.95 
 
 		 235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  63.09 
 
 		 236 aa  303  2.0000000000000002e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  61.54 
 
 		 236 aa  302  2.0000000000000002e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  64.38 
 
 		 233 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  62.82 
 
 		 237 aa  301  5.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  63.09 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  61.8 
 
 		 237 aa  298  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  60.09 
 
 		 236 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  62.66 
 
 		 235 aa  295  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  60.26 
 
 		 234 aa  293  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.08 
 
 		 247 aa  292  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  58.12 
 
 		 234 aa  291  5e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  61.34 
 
 		 247 aa  289  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  58.12 
 
 		 236 aa  290  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  61.11 
 
 		 234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  58.4 
 
 		 247 aa  288  7e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  58.12 
 
 		 234 aa  287  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  63.52 
 
 		 238 aa  287  9e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  60.52 
 
 		 236 aa  287  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  58.97 
 
 		 236 aa  286  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  62.82 
 
 		 245 aa  286  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  59.4 
 
 		 256 aa  285  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  56.65 
 
 		 238 aa  284  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  56.65 
 
 		 238 aa  284  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  58.12 
 
 		 234 aa  284  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  57.51 
 
 		 260 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  58.4 
 
 		 247 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  56.22 
 
 		 238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  57.08 
 
 		 238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  60.52 
 
 		 236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  57.98 
 
 		 247 aa  282  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  58.55 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  57.51 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  59.23 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  61.8 
 
 		 234 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  59.23 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  60.52 
 
 		 237 aa  281  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  60.68 
 
 		 234 aa  281  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1482  ABC transporter related  59.23 
 
 		 234 aa  280  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  57.98 
 
 		 247 aa  279  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  61.54 
 
 		 256 aa  279  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  57.51 
 
 		 235 aa  279  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  57.08 
 
 		 238 aa  279  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  56.65 
 
 		 238 aa  278  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  57.08 
 
 		 237 aa  278  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  57.08 
 
 		 234 aa  278  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  57.51 
 
 		 244 aa  278  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 237 aa  277  8e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  58.4 
 
 		 247 aa  277  9e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  56.65 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  56.65 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  58.72 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  55.36 
 
 		 234 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  58.72 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  63.68 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  59.57 
 
 		 236 aa  275  4e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  55.79 
 
 		 249 aa  275  4e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  59.23 
 
 		 234 aa  274  8e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  58.3 
 
 		 247 aa  274  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  58.3 
 
 		 247 aa  274  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  54.7 
 
 		 238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.69 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  57.51 
 
 		 237 aa  272  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  57.08 
 
 		 240 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  56.22 
 
 		 242 aa  271  8.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  53.22 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.22 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  55.36 
 
 		 237 aa  269  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  56.54 
 
 		 246 aa  269  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  55.98 
 
 		 243 aa  269  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  58.8 
 
 		 234 aa  269  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  55.79 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 		 235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  54.08 
 
 		 238 aa  268  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.79 
 
 		 234 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  56.6 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.79 
 
 		 238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.79 
 
 		 238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  54.94 
 
 		 234 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>