More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2551 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  100 
 
 
220 aa  442  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  43.4 
 
 
214 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  42.93 
 
 
214 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  40.09 
 
 
210 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  41.15 
 
 
208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  38.21 
 
 
221 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  42.65 
 
 
215 aa  149  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  42.65 
 
 
215 aa  149  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  38.5 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  36.16 
 
 
222 aa  144  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  38.68 
 
 
210 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  41.05 
 
 
209 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  38.5 
 
 
211 aa  142  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  37.74 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  40.7 
 
 
212 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  40.12 
 
 
212 aa  134  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  36.87 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  39.61 
 
 
221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  35.94 
 
 
216 aa  131  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  35.55 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  34.76 
 
 
211 aa  129  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  31.13 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  40.12 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
216 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  33.81 
 
 
224 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  34.72 
 
 
217 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  34.93 
 
 
208 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 
230 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  33.97 
 
 
216 aa  121  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  34.6 
 
 
223 aa  119  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  36 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  35.71 
 
 
227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  44.36 
 
 
145 aa  111  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  30.48 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  29.05 
 
 
214 aa  104  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  29.05 
 
 
214 aa  104  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  29.05 
 
 
214 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  29.05 
 
 
214 aa  104  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  29.05 
 
 
214 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  29.05 
 
 
214 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  29.05 
 
 
214 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  29.05 
 
 
214 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  28.57 
 
 
214 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  31.43 
 
 
217 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  34.36 
 
 
223 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  27.62 
 
 
214 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  27.62 
 
 
214 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  31.92 
 
 
217 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  40.31 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  41.09 
 
 
225 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  28.5 
 
 
202 aa  95.1  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  37.67 
 
 
149 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 
133 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  39.71 
 
 
144 aa  90.9  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  38.69 
 
 
147 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  38.69 
 
 
147 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 
162 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 
162 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  38.06 
 
 
144 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  36.5 
 
 
154 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  39.1 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  37.4 
 
 
149 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  31.07 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  26.99 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  35.16 
 
 
513 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  35.07 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  32.85 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  29.87 
 
 
158 aa  72  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  32.14 
 
 
320 aa  71.6  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  32.89 
 
 
160 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  34.38 
 
 
513 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  33.33 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  34.81 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  34.38 
 
 
513 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  32.58 
 
 
867 aa  69.3  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  32.86 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 
410 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  34.56 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  37.98 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  29.87 
 
 
154 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 
140 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  34.13 
 
 
845 aa  67  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  32.19 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  34.23 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  32.33 
 
 
141 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  26.98 
 
 
384 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  34.93 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  36.3 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0013  signal transduction protein  35.82 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.636073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  26.98 
 
 
384 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  35 
 
 
513 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  31.97 
 
 
377 aa  65.1  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  33.85 
 
 
258 aa  65.1  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 
143 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>