More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2542 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  100 
 
 		 315 aa  642    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  52.36 
 
 		 347 aa  332  4e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  51.86 
 
 		 343 aa  329  4e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  51.53 
 
 		 343 aa  325  9e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  54.04 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  52.82 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  52.35 
 
 		 328 aa  315  9e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  48.98 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  49.67 
 
 		 348 aa  301  9e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  48.58 
 
 		 328 aa  297  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  46.18 
 
 		 326 aa  289  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  47.83 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  48.97 
 
 		 318 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  45.27 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  47.97 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  48.05 
 
 		 317 aa  279  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  46.62 
 
 		 321 aa  278  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  47 
 
 		 354 aa  278  8e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  48 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  47.14 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  45.9 
 
 		 346 aa  275  8e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  50.17 
 
 		 317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  45.39 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  43.1 
 
 		 323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  47.93 
 
 		 352 aa  268  1e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  44.9 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  44.55 
 
 		 343 aa  266  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  45.82 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  44.78 
 
 		 351 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  44.26 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  46.44 
 
 		 345 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  45.16 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  49.44 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  44.26 
 
 		 351 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  43.58 
 
 		 350 aa  258  7e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  49.81 
 
 		 291 aa  258  8e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  44.26 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  44 
 
 		 344 aa  256  5e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  43.83 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  43.71 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  43.92 
 
 		 355 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  43.71 
 
 		 360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  42.56 
 
 		 358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  44.44 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  41.25 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  41.18 
 
 		 308 aa  242  6e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  44.69 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  42.72 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  42 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  42.81 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  42.03 
 
 		 348 aa  235  6e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  40.66 
 
 		 337 aa  235  8e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  43.1 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  42.76 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  42.76 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  40 
 
 		 351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  44.77 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  39.19 
 
 		 347 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  41.64 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  42.66 
 
 		 369 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  40 
 
 		 346 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  41.05 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  41.49 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  42.23 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  41.18 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  41.05 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  41.05 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  41.05 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  42.23 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3755  selenophosphate synthetase  41.78 
 
 		 344 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  42.81 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  40.07 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  41.08 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  40.54 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5690  selenide, water dikinase  43.16 
 
 		 343 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  38.56 
 
 		 353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  40.14 
 
 		 352 aa  225  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  40.56 
 
 		 357 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3330  selenide, water dikinase  43.71 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.456858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  42.81 
 
 		 344 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0583  selenide, water dikinase  43.12 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  40.56 
 
 		 354 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  42.66 
 
 		 357 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  39.86 
 
 		 357 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  40.28 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  40.56 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  39.86 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  39.86 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  39.86 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3250  selenophosphate synthetase  41.96 
 
 		 351 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.433054  normal  0.299232 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  41.05 
 
 		 354 aa  222  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  42.12 
 
 		 344 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  40.88 
 
 		 349 aa  222  7e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  40 
 
 		 352 aa  222  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  43.51 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  42.39 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  43.16 
 
 		 344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  42.81 
 
 		 344 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  40.21 
 
 		 358 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  41.5 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>