60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2520 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2520  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  620  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1881  CRISPR-associated Csh2 family protein  55.97 
 
 
302 aa  357  9.999999999999999e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.576122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1019  CRISPR-associated Csh2 family protein  40.8 
 
 
299 aa  217  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0306  CRISPR-associated protein, Csh2 family  36.83 
 
 
318 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1184  CRISPR-associated protein, Csh2 family  37.22 
 
 
318 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0623  CRISPR-associated protein, Csh2 family  38.18 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3202  CRISPR-associated Csh2 family protein  36.33 
 
 
305 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1072  CRISPR-associated Csh2 family protein  37.17 
 
 
330 aa  187  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.618984  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0639  CRISPR-associated Csh2 family protein  33.01 
 
 
321 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285412  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1292  CRISPR-associated protein, Csh2 family  32.26 
 
 
306 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1420  CRISPR-associated protein, Csh2 family  30.13 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0231  CRISPR-associated Csh2 family protein  31.74 
 
 
291 aa  139  6e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.748958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3938  CRISPR-associated protein, CT1132 family  32.24 
 
 
316 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2426  CRISPR-associated protein, Csh2 family  27.74 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0614729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0938  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.79 
 
 
302 aa  129  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0537  CRISPR-associated Csh2 family protein  30.28 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0269  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.08 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2325  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.07 
 
 
293 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2834  CRISPR-associated protein, Csh2 family  28.29 
 
 
351 aa  115  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3331  CRISPR-associated protein, Csh2 family  28.43 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1453  CRISPR-associated protein, Csh2 family  29.45 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2663  CRISPR-associated protein, Csh2 family  29.02 
 
 
301 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0973  CRISPR-associated protein, Csh2 family  30.53 
 
 
334 aa  102  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0770  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.41 
 
 
292 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15240  CRISPR-associated protein, Csh2 family  27.34 
 
 
302 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4290  CRISPR-associated protein, CT1132 family  26.23 
 
 
356 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1067  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.73 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0472036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3522  CRISPR-associated Csd2 family protein  30.5 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1005  CRISPR-associated Csd2 family protein  25.55 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1480  CRISPR-associated protein, Csd2 family  28.37 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1158  CRISPR-associated Csd2 family protein  26.79 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0654  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.78 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1486  Csd2 family CRISPR-associated protein  33.11 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0831  CRISPR-associated Csd2 family protein  24.23 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3382  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  26.07 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.860383  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1976  CRISPR-associated protein, Csd2 family  26.28 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.856064  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0236  CRISPR-associated Csd2 family protein  31.54 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1631  CRISPR-associated protein, Csd2 family  26.44 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.835293  normal  0.948126 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1298  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.11 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.841348  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0604  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.78 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.520474  normal  0.472142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02698  crispr-associated protein, Csd2 family  24.61 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3344  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.09 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00748339  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2975  CRISPR-associated Csd2 family protein  23.55 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1938  CRISPR-associated Csh2 family protein  25 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364907  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0823  CRISPR-associated protein, Csd2 family  25.81 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0495  CRISPR-associated Csh2 family protein  30.56 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0478  hypothetical protein  25 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3579  Csd2 family CRISPR-associated protein  29.56 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31600  CRISPR-associated protein Csd2  22.11 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1726  CRISPR-associated Csd2 family protein  28.1 
 
 
359 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111007  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0353  hypothetical protein  26.14 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.171823  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3648  CRISPR-associated protein, Csd2 family  37.31 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3904  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.15 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.264914  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1660  CRISPR-associated protein, Csd2 family  25.17 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1007  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.83 
 
 
280 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0847  hypothetical protein  36.21 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1974  CRISPR-associated protein, Csd2 family  22.56 
 
 
317 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1433  CRISPR-associated Csd2 family protein  41.67 
 
 
366 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.562068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0795  CRISPR-associated protein TM1801  28.43 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3868  CRISPR-associated protein TM1801  29.29 
 
 
307 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>