48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2517 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  347  3e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  52.8 
 
 		 168 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  50.89 
 
 		 169 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  54.04 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  53.25 
 
 		 169 aa  179  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  51.19 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  51.85 
 
 		 163 aa  170  9e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  46.58 
 
 		 165 aa  167  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  53.61 
 
 		 169 aa  167  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  52.44 
 
 		 165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  45.34 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  40.99 
 
 		 162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.37 
 
 		 178 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  38.27 
 
 		 177 aa  137  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  46.3 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.89 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.02 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  35.58 
 
 		 199 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.33 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  32.93 
 
 		 189 aa  104  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  33.73 
 
 		 169 aa  104  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  32.14 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  34.34 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.36 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.04 
 
 		 159 aa  101  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  33.74 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.53 
 
 		 173 aa  98.2  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  33.33 
 
 		 192 aa  97.1  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  34.36 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.52 
 
 		 177 aa  94.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  32.54 
 
 		 166 aa  90.9  7e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  33.54 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  33.74 
 
 		 165 aa  87.8  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  31.33 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  36.05 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.54 
 
 		 172 aa  84.3  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  31.93 
 
 		 161 aa  84.3  8e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  29.88 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  32.52 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  29.63 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.12 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  28.73 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  35.15 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  24.54 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  24.85 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  30.77 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  25.13 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  24.73 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>