More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2458 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  796    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  61.17 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  47.86 
 
 		 397 aa  353  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  42.86 
 
 		 400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1983  protein of unknown function DUF214  46.63 
 
 		 400 aa  299  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  41.22 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  40.34 
 
 		 406 aa  259  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  40.87 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  37.62 
 
 		 409 aa  256  3e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  36.59 
 
 		 405 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  36.72 
 
 		 409 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  36.79 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  37.91 
 
 		 409 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  37.22 
 
 		 401 aa  247  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  39 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  37.97 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  36.23 
 
 		 405 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3785  hypothetical protein  41.69 
 
 		 398 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  36.36 
 
 		 443 aa  239  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  38.38 
 
 		 409 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  38.38 
 
 		 409 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  39.23 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  36.89 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  35.47 
 
 		 406 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  37.5 
 
 		 409 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  37.99 
 
 		 409 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  37.66 
 
 		 392 aa  235  8e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  35.63 
 
 		 405 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4950  ABC transporter, permease  42.12 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5345  ABC transporter, permease  42.12 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5426  ABC transporter, permease  42.12 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  35.09 
 
 		 403 aa  234  3e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  37.72 
 
 		 405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  37.66 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  34.73 
 
 		 405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5378  ABC transporter permease protein  41.87 
 
 		 400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4935  ABC transporter, permease  41.04 
 
 		 399 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5578  ABC transporter, permease  41.63 
 
 		 400 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.707712 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  40.8 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5372  ABC transporter, permease protein  41.87 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  36.5 
 
 		 409 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  35.24 
 
 		 405 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  37.14 
 
 		 681 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  37.14 
 
 		 681 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  35.24 
 
 		 405 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  37.59 
 
 		 405 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  37.59 
 
 		 405 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  35.73 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5104  ABC transporter permease  40.65 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5495  ABC transporter permease  40.65 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  36.88 
 
 		 687 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  36.79 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  37.81 
 
 		 409 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  34.05 
 
 		 418 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5048  hypothetical protein  39.9 
 
 		 399 aa  225  9e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  35.35 
 
 		 658 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  36.27 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  35.95 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  38.4 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  38.15 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  33.33 
 
 		 410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  37.01 
 
 		 413 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  38.75 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  36.32 
 
 		 408 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  33.33 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  37.88 
 
 		 650 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  34.25 
 
 		 653 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  35.54 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  34.92 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  35.68 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  33.25 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  36.8 
 
 		 373 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  34.31 
 
 		 406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  34.78 
 
 		 668 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  32.02 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  36.27 
 
 		 668 aa  219  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  36.27 
 
 		 668 aa  219  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  37.47 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  35.32 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  35.58 
 
 		 653 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  35.23 
 
 		 653 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  35.58 
 
 		 653 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  35.58 
 
 		 653 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  35.71 
 
 		 410 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  34.08 
 
 		 647 aa  216  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  33.75 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  34.51 
 
 		 648 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  35.65 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  37.71 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  37.71 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  34.67 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.83 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  34.67 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  33.84 
 
 		 653 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  35.25 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  33.42 
 
 		 653 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  35.32 
 
 		 651 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  36.82 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  36.82 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>