More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2418 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3141  CTP synthetase  55.37 
 
 
572 aa  642    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151944  normal  0.766797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  57.73 
 
 
545 aa  636    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  64.35 
 
 
535 aa  744    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  57.49 
 
 
536 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  62.45 
 
 
540 aa  694    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  59.06 
 
 
536 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2692  CTP synthetase  55.26 
 
 
536 aa  635    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  62.06 
 
 
535 aa  728    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  56.88 
 
 
552 aa  636    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  58.04 
 
 
558 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  64.17 
 
 
535 aa  744    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  61.08 
 
 
555 aa  708    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0105  CTP synthetase  58.99 
 
 
569 aa  660    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000148991  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  57.06 
 
 
534 aa  669    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  56.47 
 
 
533 aa  644    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  60.41 
 
 
534 aa  667    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  64.73 
 
 
535 aa  746    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  64.54 
 
 
535 aa  745    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  58.41 
 
 
534 aa  640    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  64.35 
 
 
535 aa  743    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3169  CTP synthetase  58.67 
 
 
545 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659472  normal  0.252968 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  57.69 
 
 
545 aa  636    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  60.37 
 
 
542 aa  675    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  60.67 
 
 
533 aa  672    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  60.52 
 
 
557 aa  707    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  57.51 
 
 
581 aa  657    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  59.28 
 
 
555 aa  677    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  57.46 
 
 
555 aa  644    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  63.98 
 
 
535 aa  743    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  58.98 
 
 
545 aa  681    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  63.96 
 
 
537 aa  724    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  62.36 
 
 
536 aa  732    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  58.54 
 
 
534 aa  669    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  59.47 
 
 
555 aa  679    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0100  CTP synthetase  56.59 
 
 
597 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000644202  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  57.59 
 
 
549 aa  660    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0608  CTP synthetase  57.33 
 
 
553 aa  640    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.235124  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  58.71 
 
 
549 aa  670    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  59.02 
 
 
538 aa  670    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  57.06 
 
 
548 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  65.6 
 
 
533 aa  745    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  64.73 
 
 
535 aa  746    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  59.09 
 
 
536 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  59.17 
 
 
546 aa  674    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03082  CTP synthetase  57.35 
 
 
543 aa  637    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000772842  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1911  CTP synthetase  57.64 
 
 
581 aa  636    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115982  hitchhiker  0.000439643 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  65.65 
 
 
537 aa  753    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  60.38 
 
 
533 aa  656    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  55.74 
 
 
608 aa  661    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  64.43 
 
 
542 aa  743    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  58.99 
 
 
536 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  58.87 
 
 
536 aa  674    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1236  CTP synthetase  57.91 
 
 
545 aa  638    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000161678  hitchhiker  0.00000000200253 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11714  CTP synthetase  56.27 
 
 
586 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.24232 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  62.36 
 
 
536 aa  732    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  58.12 
 
 
545 aa  635    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2959  CTP synthetase  56.09 
 
 
579 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  57.44 
 
 
534 aa  662    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  57.73 
 
 
545 aa  636    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  59.93 
 
 
534 aa  690    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  57.14 
 
 
543 aa  641    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  57.57 
 
 
558 aa  645    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  57.73 
 
 
545 aa  636    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  57.54 
 
 
545 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  59.26 
 
 
545 aa  681    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2944  CTP synthetase  56.09 
 
 
579 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  58.8 
 
 
551 aa  669    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  57.86 
 
 
543 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  63.71 
 
 
533 aa  738    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  56.31 
 
 
539 aa  652    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  64.03 
 
 
535 aa  739    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  64.03 
 
 
535 aa  739    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  56.12 
 
 
652 aa  641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  58.59 
 
 
571 aa  685    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  57.91 
 
 
546 aa  636    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  57.73 
 
 
546 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0139  CTP synthetase  58.8 
 
 
564 aa  640    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  56.64 
 
 
553 aa  654    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  100 
 
 
542 aa  1112    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  63.98 
 
 
535 aa  741    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0097  CTP synthetase  58.43 
 
 
565 aa  649    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000852269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  58.24 
 
 
535 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  56.45 
 
 
544 aa  660    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0127  CTP synthetase  58.48 
 
 
565 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00118527  decreased coverage  0.00108847 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  56.25 
 
 
537 aa  640    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  57.25 
 
 
534 aa  655    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1519  CTP synthetase  56.17 
 
 
597 aa  648    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154813  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  60.67 
 
 
533 aa  676    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  60.94 
 
 
534 aa  707    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  57.83 
 
 
555 aa  644    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  57.91 
 
 
546 aa  636    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1243  CTP synthetase  57.49 
 
 
558 aa  637    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0811753  normal  0.94922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  58.03 
 
 
535 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2661  CTP synthetase  57.65 
 
 
565 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00871872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2485  CTP synthetase  55.51 
 
 
569 aa  650    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.996454  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  59.09 
 
 
555 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2988  CTP synthetase  56.09 
 
 
579 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  56.31 
 
 
535 aa  640    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  61.05 
 
 
533 aa  682    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  57.38 
 
 
536 aa  655    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>