More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2395 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2395  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  650    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.34 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.85 
 
 
348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5452  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  40.66 
 
 
346 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5504  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  40.96 
 
 
346 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000376853  unclonable  1.14998e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5123  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.66 
 
 
346 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5448  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  40.66 
 
 
346 aa  229  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.011245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5174  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  40.66 
 
 
346 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5009  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  40.66 
 
 
346 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000874149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5025  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  40.66 
 
 
346 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00487742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5568  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  40.66 
 
 
346 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00343157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5503  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  40.66 
 
 
346 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5417  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  40.66 
 
 
346 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.7505e-62 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0139  translation factor SUA5  39.82 
 
 
350 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3846  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.27 
 
 
347 aa  219  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00967711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3166  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.9 
 
 
354 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2862  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.04 
 
 
367 aa  212  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566964 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2395  translation factor SUA5  48.23 
 
 
352 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.02 
 
 
359 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00354892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4831  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.95 
 
 
348 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0105572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  36.23 
 
 
351 aa  205  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.97 
 
 
358 aa  204  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4181  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.32 
 
 
343 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000833844  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2151  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.58 
 
 
358 aa  202  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4186  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.67 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  hitchhiker  0.00000330857 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1813  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.24 
 
 
366 aa  199  5e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00420003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4092  translation factor SUA5  47.48 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.34 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17950  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.12 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4321  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.04 
 
 
356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.98 
 
 
341 aa  196  6e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2011  translation factor SUA5  36.92 
 
 
350 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.03 
 
 
350 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0400  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.88 
 
 
345 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1686  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  37.77 
 
 
315 aa  193  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0067  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.88 
 
 
338 aa  193  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0048533  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0807  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.35 
 
 
338 aa  193  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0096  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.17 
 
 
354 aa  192  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2174  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.03 
 
 
350 aa  192  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.22 
 
 
317 aa  192  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0454  translation factor SUA5  41.64 
 
 
342 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.81 
 
 
335 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138931  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0901  translation factor SUA5  53.65 
 
 
367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1961  translation factor SUA5  36.76 
 
 
335 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2287  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.69 
 
 
346 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.036585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.2 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0496  translation factor SUA5  36.53 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.64 
 
 
331 aa  183  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.75 
 
 
327 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.45 
 
 
347 aa  182  7e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.231595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3747  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.96 
 
 
352 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.585251  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0487  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.17 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1598  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.11 
 
 
331 aa  179  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1246  putative translation factor (SUA5)  49.25 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.377442  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0598  hypothetical protein  45.41 
 
 
329 aa  179  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0281  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47 
 
 
358 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000413141 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1193  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.95 
 
 
330 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0231  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.5 
 
 
335 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00706793  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1565  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  44.29 
 
 
324 aa  177  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1674  Sua5/YciO/YrdC family protein  40.98 
 
 
328 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1371  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.98 
 
 
328 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1782  translation factor SUA5  35.76 
 
 
337 aa  176  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1345  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.12 
 
 
358 aa  176  6e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.165171 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33949  predicted protein  34.3 
 
 
387 aa  175  7e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.36 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.865666 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0403  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.56 
 
 
316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0735  hypothetical protein  33.44 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2777  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.53 
 
 
360 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.389142  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1773  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.01 
 
 
344 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1129  translation factor SUA5  33.85 
 
 
342 aa  170  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.712413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0452  translation factor SUA5  50.25 
 
 
331 aa  170  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1995  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.77 
 
 
319 aa  170  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4587  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.25 
 
 
329 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.09 
 
 
326 aa  169  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0150257  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0743  translation factor SUA5  37.23 
 
 
312 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.763495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3187  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.91 
 
 
370 aa  169  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  46 
 
 
364 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10771  translation initiation protein Sua5 (AFU_orthologue; AFUA_2G09160)  47.62 
 
 
427 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0142464  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0507  translation factor SUA5  36.42 
 
 
330 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160879  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.44 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0378  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.07 
 
 
349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  0.126735 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1857  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.77 
 
 
322 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1749  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.6 
 
 
345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172136  normal  0.622284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3895  translation factor SUA5  34.78 
 
 
314 aa  165  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2399  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.31 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3265  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.53 
 
 
345 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0755  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.89 
 
 
344 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00940805  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1267  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.14 
 
 
326 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1394  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.92 
 
 
324 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.406188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0075  translation factor SUA5  39.41 
 
 
313 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3271  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.76 
 
 
346 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.917971 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4625  translation factor SUA5  50 
 
 
331 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0484  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.73 
 
 
337 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3861  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.67 
 
 
327 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2463  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.23 
 
 
312 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.201158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4105  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.92 
 
 
329 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854949  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4473  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.92 
 
 
329 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0669  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.84 
 
 
341 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1580  translation factor SUA5  44.67 
 
 
337 aa  159  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0497  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.23 
 
 
337 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271479  normal  0.123391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>