More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2386 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  100 
 
 
173 aa  347  5e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  48.99 
 
 
189 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  43.62 
 
 
165 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  36.2 
 
 
168 aa  103  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  32.67 
 
 
164 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  33.74 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  33.74 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  33.74 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  33.74 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  33.74 
 
 
168 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  37.25 
 
 
168 aa  94.7  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  33.74 
 
 
168 aa  94.4  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  33.74 
 
 
168 aa  94.4  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  33.74 
 
 
168 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  33.74 
 
 
168 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  33.74 
 
 
168 aa  94.4  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  36.49 
 
 
203 aa  91.7  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  38.78 
 
 
163 aa  91.3  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  34.48 
 
 
166 aa  90.9  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  31.74 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  31.74 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  31.43 
 
 
179 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  30.18 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  33.96 
 
 
167 aa  84  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  32.64 
 
 
159 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  32.64 
 
 
159 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  27.88 
 
 
238 aa  84  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0079  ATP synthase F0, B subunit  38.41 
 
 
162 aa  82  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  32.43 
 
 
206 aa  82  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  31.72 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  32.26 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  32.41 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  31.72 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  32.89 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  33.78 
 
 
199 aa  77.4  0.00000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  31.85 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  29.45 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  29.7 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  30.57 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  34.64 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  35.33 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  35.33 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  32.68 
 
 
156 aa  72  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  28.17 
 
 
172 aa  72  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  27.54 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  28.19 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  30.52 
 
 
166 aa  70.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  35.37 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  31.47 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  30.72 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  31.91 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  35 
 
 
245 aa  68.2  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  27.89 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  27.52 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  28.4 
 
 
192 aa  67.4  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2801  F-type H+-transporting ATP synthase, subunit B  32 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0112017  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  28.38 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  33.1 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  31.91 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  30.23 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  24.52 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  29.34 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  27.56 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  31.91 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  32.62 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  27.52 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  29.17 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  28.95 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  26.9 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  26.39 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  30.97 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  31.33 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  26.54 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  25 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  29.17 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>