247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2363 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  100 
 
 
508 aa  1048  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  61.79 
 
 
884 aa  548  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  48 
 
 
878 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  47.76 
 
 
878 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  50.38 
 
 
399 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  50.63 
 
 
399 aa  435  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  50.63 
 
 
400 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  51.02 
 
 
397 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.25791e-05  hitchhiker  6.1463e-07 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  44.56 
 
 
407 aa  371  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  42.42 
 
 
407 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  43.69 
 
 
407 aa  368  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  43.88 
 
 
407 aa  363  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  44.27 
 
 
407 aa  363  5e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  41.92 
 
 
425 aa  359  8e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  42.09 
 
 
407 aa  355  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  41.12 
 
 
395 aa  324  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.74578e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  38.99 
 
 
396 aa  313  6e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.65819e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  40 
 
 
423 aa  308  1e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  38.48 
 
 
395 aa  303  3e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  39.65 
 
 
431 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  37.97 
 
 
395 aa  300  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  38.01 
 
 
421 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  37.21 
 
 
409 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.22 
 
 
397 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  37.25 
 
 
402 aa  264  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  36.09 
 
 
405 aa  260  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  35.52 
 
 
393 aa  254  4e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  34.26 
 
 
392 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  35.37 
 
 
397 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.36277e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  37.06 
 
 
391 aa  247  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.16658e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  34.98 
 
 
396 aa  247  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  34.01 
 
 
396 aa  247  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 
387 aa  245  1e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  36.2 
 
 
399 aa  244  2e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  7.05459e-05 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 
387 aa  242  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  34.21 
 
 
571 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  35.34 
 
 
392 aa  236  7e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  34.01 
 
 
401 aa  236  9e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  40.45 
 
 
575 aa  235  1e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 
398 aa  235  1e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
405 aa  235  1e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.58 
 
 
479 aa  234  2e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.83 
 
 
498 aa  234  2e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.58 
 
 
479 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.35155e-06 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.58 
 
 
479 aa  234  4e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.58 
 
 
479 aa  234  4e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.5 
 
 
396 aa  234  4e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.11538e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  34.09 
 
 
397 aa  233  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
387 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  34.52 
 
 
403 aa  233  7e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  31.93 
 
 
402 aa  233  8e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  40 
 
 
576 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  36.21 
 
 
399 aa  232  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.33 
 
 
479 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  34.18 
 
 
395 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.7389e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.33 
 
 
479 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  40 
 
 
576 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.33 
 
 
479 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.33 
 
 
479 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  32.33 
 
 
479 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.33 
 
 
479 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.33 
 
 
479 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  36.05 
 
 
582 aa  230  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 
479 aa  229  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.08 
 
 
479 aa  229  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.58 
 
 
485 aa  229  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.25 
 
 
574 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.15 
 
 
396 aa  229  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.08 
 
 
479 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  32.83 
 
 
387 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  32.51 
 
 
401 aa  227  5e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.08 
 
 
482 aa  226  7e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 
393 aa  226  7e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.42 
 
 
397 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 
396 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.38 
 
 
394 aa  225  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  3.51493e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.16 
 
 
505 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.46 
 
 
575 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.58 
 
 
504 aa  223  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  31.94 
 
 
418 aa  223  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.47 
 
 
499 aa  222  1e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  33.42 
 
 
576 aa  221  2e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  34.74 
 
 
574 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.9 
 
 
503 aa  221  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 
387 aa  220  4e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.4 
 
 
500 aa  221  4e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.59 
 
 
575 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.59 
 
 
575 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  30.92 
 
 
579 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.19 
 
 
575 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.65 
 
 
493 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  31.33 
 
 
572 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  34.22 
 
 
400 aa  218  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1376  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 
591 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 
402 aa  216  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00571  flavoprotein  33.42 
 
 
592 aa  216  8e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.99 
 
 
400 aa  215  1e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2530  flavoprotein  31.36 
 
 
582 aa  215  1e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.707378 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 
384 aa  215  2e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  31.67 
 
 
404 aa  214  3e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>