More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2347 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  61.14 
 
 		 175 aa  237  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  60.57 
 
 		 175 aa  235  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  63.37 
 
 		 175 aa  227  7e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  60.11 
 
 		 177 aa  225  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  56.57 
 
 		 174 aa  225  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  63.43 
 
 		 175 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  60.92 
 
 		 182 aa  216  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  60.92 
 
 		 182 aa  216  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  65.5 
 
 		 175 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  59.2 
 
 		 182 aa  209  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  59.55 
 
 		 178 aa  209  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  53.37 
 
 		 181 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  50 
 
 		 194 aa  207  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  55.25 
 
 		 177 aa  207  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  59.55 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  49.21 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  54.39 
 
 		 187 aa  203  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  53.8 
 
 		 188 aa  202  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  55 
 
 		 172 aa  201  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  54.97 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  55.49 
 
 		 174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  61.24 
 
 		 177 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  55.56 
 
 		 176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  60.11 
 
 		 177 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  54.39 
 
 		 173 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  54.39 
 
 		 173 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  60.11 
 
 		 177 aa  194  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  60.11 
 
 		 177 aa  194  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  60.11 
 
 		 177 aa  194  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  60.11 
 
 		 177 aa  194  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  60.11 
 
 		 177 aa  194  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  60.11 
 
 		 177 aa  194  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  60.11 
 
 		 177 aa  194  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  60.11 
 
 		 177 aa  194  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  50.87 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  49.42 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  52.3 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  45.74 
 
 		 266 aa  185  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  51.72 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  47.13 
 
 		 178 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  51.72 
 
 		 177 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  44.1 
 
 		 266 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  51.72 
 
 		 177 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  50 
 
 		 181 aa  182  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  50.29 
 
 		 178 aa  181  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  41.55 
 
 		 272 aa  180  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  46.33 
 
 		 243 aa  180  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  42.93 
 
 		 272 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  41.04 
 
 		 271 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  48.82 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  48.54 
 
 		 177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  45.24 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  40.28 
 
 		 270 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  40.28 
 
 		 270 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  48.54 
 
 		 175 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  43.92 
 
 		 280 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  44.79 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  46.51 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  41.15 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  47.95 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  47.4 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  43.98 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  47.37 
 
 		 175 aa  174  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  47.37 
 
 		 175 aa  174  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  47.95 
 
 		 175 aa  175  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  46.52 
 
 		 188 aa  174  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  41.43 
 
 		 276 aa  174  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  42 
 
 		 266 aa  174  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  44.26 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  47.67 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  48.28 
 
 		 174 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  45.45 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  47.49 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  45.45 
 
 		 277 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  47.67 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  46.24 
 
 		 176 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  48.88 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  41.84 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  44.57 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0675  NusG antitermination factor  42.15 
 
 		 320 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  47.09 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  45.09 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  42.86 
 
 		 299 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  39.44 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  39.52 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  41.76 
 
 		 192 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  45.16 
 
 		 196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  47.09 
 
 		 196 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  42.55 
 
 		 306 aa  171  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  44.97 
 
 		 203 aa  171  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  41.06 
 
 		 242 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  43.46 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000249386  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  44.2 
 
 		 242 aa  170  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  45.21 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  46.51 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  45.21 
 
 		 193 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  42.71 
 
 		 287 aa  168  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  46.24 
 
 		 177 aa  168  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>