More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2328 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  100 
 
 		 113 aa  228  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  65.18 
 
 		 116 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  64.86 
 
 		 113 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  59.09 
 
 		 114 aa  144  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  60.55 
 
 		 113 aa  143  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  60.36 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  58.56 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  57.66 
 
 		 113 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  57.66 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  57.66 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  57.66 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  57.66 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  57.66 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  57.66 
 
 		 113 aa  138  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  57.66 
 
 		 113 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  57.66 
 
 		 113 aa  138  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  57.66 
 
 		 113 aa  138  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  57.66 
 
 		 113 aa  138  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  56.76 
 
 		 113 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  57.8 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  57.8 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  57.8 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  58.56 
 
 		 113 aa  133  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  59.26 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1280  ribosomal protein L22  60.95 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  54.05 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  56.76 
 
 		 111 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  61.54 
 
 		 111 aa  130  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  53.15 
 
 		 113 aa  130  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  57.27 
 
 		 110 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 110 aa  124  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  56.76 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 		 159 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  51.82 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  53.64 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  54.05 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 110 aa  121  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  56.19 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 		 110 aa  120  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 110 aa  120  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  53.1 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  58.18 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  54.55 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  53.7 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0785  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.363431  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  56.73 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  57.94 
 
 		 110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  54.95 
 
 		 111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  53.64 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  54.21 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 		 113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  53.15 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0986  ribosomal protein L22  53.15 
 
 		 114 aa  116  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.631891  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  51.82 
 
 		 110 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  52.54 
 
 		 122 aa  115  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  52.68 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  54.63 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  52.68 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  49.55 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  50.85 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 		 111 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 		 111 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  53.77 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  51.75 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2367  ribosomal protein L22  52.29 
 
 		 110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.414165  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  52.59 
 
 		 123 aa  113  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  54.13 
 
 		 110 aa  113  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  49.54 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0333  ribosomal protein L22  53.64 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>